问题 老师，根据您的课程分析拟南芥WRKY基因家族，进化树构建时出现No common sites found for computing distances，该怎样解决？已把大的gap删除

问题 你好，我也遇到了相同的问题“PSMC分析有效群体大小（Ne）,跑出来的psmc.fa文件是空的”，请问你的问题解决了吗？ 我的测序深度是150X

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问题 老师我想做GWAS分析找油脂含量及相关脂肪酸的候选基因，可以通过采我要研究的物种的叶片去测序，收集的种子测油脂含量和脂肪酸组成吗

问题 老师，我想问一下，我正在学泛基因家族分析；自己的数据如何上传？是弄成压缩包的形式通过filezilla上传到data文件夹，覆盖之前上传的课程内容吗？

问题 老师，我用perl $scriptdir/vcf2hmp.pl clean.vcf.gz hapmap.txt.gz这个之后用gapit的那些模型分析时总是报错

问题 老师，我用perl $scriptdir/vcf2hmp.pl clean.vcf.gz hapmap.txt.gz这个之后用gapit的那些模型分析时总是报错

文章 挖掘公共基因大数据的时代已经到来

...部分科研工作者一般对自有的实验材料进行数据收集，在分析层面一般仅关注某几个具体的角度，并没有全面的发掘数据的潜力。 大数据挖掘时代 随着大量的数据产生，大规模样本，多组学的复杂数据在公共数据上堆积如山...

问题 您好，我用cytoscape 的BinGO进行GO富集分析时，参照你们提供的无参 GO注释的demo, 怎么运行不了？请您指教

这是您的教程，https://www.omicsclass.com/article/339  ，我做的是非模式植物的，用你们的demo，准备GO 注释数据，(species=sss_aa)(type=consortium)(curator=GO) i0_HQ_W_c10162/f2p0/728 = 0015078 i0_HQ_W_c10176/f5p0/771 = 0006457 我这个格式有错吗？ 谢谢， 照你...

问题 请问一下prefetch下载的问题

sratoolkit 2.10.5和aspera 3.9.1都安装好了，但是用prefetch SRRxxx 没有自动调用，还是通过https下载，而且比网上看到的很多都要慢。 在网上又找到这种方法prefetch -t ascp -a "/home/user/.aspera/connect/bin/ascp|/home/user/.aspera/connect/etc/asperaweb_id_dsa...

问题 老师，您好，我正在泛基因家族分析，想问课程中用到的结构变异的vcf文件all_merge.vcf是泛基因组全基因组范围的变异吗，

老师，您好，我正在泛基因家族分析，想问课程中用到的结构变异的vcf文件all_merge.vcf是泛基因组全基因组范围的变异吗，如果作者那边要不上，可以要部分的话，我这边是要foxtail_millet.GRASgene.list  文件呢，其中中有5502个（在02....

问题 wgcna

...23。我后面要根据GS>0.2和MM》0.8筛选hub gene，然后做后续分析。黑色的模块还能用来分析吗，是不是要舍弃掉。它的cor实在是低，并且P值＞0.05。红色模块是不是还可以继续分析。

问题 老师您好，请我一下您这里或是哪里有关于WGCNA分析的性状数据准备的详细介绍的资料或课程吗？因为我之前买了您这里的关于WGCNA分析的课程，但是课程里面用到的性状数据应该属于类别性状，用了01转换的，那要是数量性状应该具体是如何准备的我也不太理解，我看有人提到说是表达量，我也不太理解这个表达量指什么？请问老师有相关课程或资料吗？您这里有篇文章是讲了这两种性状数据，但是描述的有点简单。

问题 老师您好，我在做物种间共线性分析绘图时，显示list index out of range,我检查了准备的bed文件和cds文件没问题。请问这种情况怎么处理?

问题 按照课程所讲，在 使用docker的rnaseq:latest镜像进行基因分析时，报错显示没有DESeq2； 安装DESeq2包时又显示错误， 有人知道这种情况怎么解决吗？