问题 BSA分析中QTL-seq组学大讲堂给出的修改过的参考连接内容怎么跟原版是一样的，请问修改过的在哪里可以下载？

问题 老师，我在做饭基因家族分析，我搜集的基因组的gff3文件，第一列有的是chr有的是基因id，这个会影响后续结果嘛？

问题 服务器putty上可以进行内存设定和线程设定吗？我按照基因家族环境分析环境搭建ppt上，对内存和线程进行设定，但是在putty上运行不了。

问题 求助，有没有用过smudgeplot做过倍性分析的大佬，对psmudgeplot.py plot参数有疑惑，请问应该然后解决，感谢

smudgeplot.py plot kmcdb_L"$L"_U"$U"_pairs.tsv usage: smudgeplot plot [-h] [-o O] [-c C] [-t TITLE] [-ylim YLIM] [-col_ramp COL_RAMP] [--invert_cols]                        infile smudgefile n smudgeplot plot: error: the following arguments are required: smudgefile, n

问题 老师您好！用meme分析motif时显示zsh：no such file or directory:/biosoft/meme/meme-v4.12.0/bin/meme。该怎么解决这个问题呢？谢谢

老师您好！用meme分析motif时，输入/biosoft/meme/meme-v4.12.0/bin/meme ../WRKY_pep_confirmed.fa -protein -oc ./ -nostatus -time 18000 -maxsize 6000000 -mod anr -nmotifs 10 -minw 6 -maxw 100命令后显示zsh：no such file or directory:/biosoft/meme/meme-v4.12.0/bin/meme。该怎么解决...

文章 vi基本替换

...所有 A 为 B, n 为数字，若 n 为 .，表示从当前行到最后 5 :%s/A/B/ #替换每一行的第一个 A 为 B 6 :%s/A/B/g # 替换每一行中所有 A 为 B

问题 老师您好，我在做不同物种之间共线性分析的时候，在#绘制共线性图片：准备两个配置文件为输入文件出现如下错误：IOError: [Errno 2] No such file or directory: 'mcscan_layout'

我在做不同物种之间共线性分析的时候，在#绘制共线性图片：准备两个配置文件为输入文件出现如下错误：IOError: [Errno 2] No such file or directory: 'mcscan_layout' 目录下的文件

文章 下载TCGA基因表达量文件，应该选Count,FPKM还是FPKM-UQ ?

...-UQ有啥差别，这个可以查看GDC的官方说明文档中的转录组分析部分，两者的计算公式：     RCg: 比对到基因上的reads数量     RCpc: 比对到所有编码蛋白基因上的reads数量     RCg75: 样品中75%分位对应的基因reads数目     ...

问题 老师，您好！我看到有些物种的基因组未完成基因组测序，但是做了转录组基因家族分析的文章，我想知道他们是如何获得基因的各个序列的呢

问题 老师好！做比较基因组分析时/biosoft/miniconda/miniconda2/bin/python -m jcvi.compara.catalog ortholog ATH OEH --cscore=0.7 报错

问题 老师好！我的物种基因注释水平在scaffold，之前课程里面的思路和脚本是否还适用？我需要有什么注意事项？附有参考文献分析方法和数据。求老师指导。感谢！

问题 老师，我做转录组和基因组对比得不到结果。图一是summary输出结果，图二是命令。希望您帮忙分析一下问题出在什么地方 谢谢您了 index

问题 老师您好，做比较基因组分析时，单拷贝同源基因的这个文件是空的Orthogroups_SingleCopyOrthologues，并且orthofinder文件夹也是空的，是什么原因造成的

问题 请问老师，我看基因家族分析视频中基因定位染色体用的拟南芥的DNA文件，我做的植物,没有DNA这个文件，可以用其他文件做吗？

或者有什么软件可以跳过DAN文件做定位？

问题 测序公司发来的是组装好的测序结果，其中里面有全基因组的序列（fa格式），这用组数据可否进行“基因组重测序分析”课程中讲的snp，indel，sv等分析呢？

测序公司发来的是组装好的测序结果，其中里面有全基因组的序列（fa格式），这用组数据可否进行“基因组重测序分析”课程中讲的snp，indel，sv等分析呢？