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问题 位点注释老师出错,跑不出想要的VCF+txt文件,使用annotate_variation.pl不会报错

...astring . -otherinfo>(请问老师这是为什么?哪里出错了?怎么一直出错啊,我应该怎么跑啊?) annotated_variants.refGene.exonic_variant_function.orig文件内容:line3523389 nonsynonymous SNV Os10g0100200:Os10t0100200-01:exon1:c.G87C:p.W29C chr10 44989 44989 ...

文章 biolinux共享目录文件夹建立及注意事项

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文章 基因结构图修改ID

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问题 你好,我想请问一下。像在这篇土豆的文章里,ARF家族成员从1-28的编号,这个命名规则是怎样的啊?是作者人工定义的,但总有个编号排序的规则?

Pan-genome identification and expression analysis of the ARF gene family in potato在这篇文章里,作者鉴定出28个ARF基因家族成员,我想知道从ARF1到ARF28是怎么根据什么命名的哇

文章 ANNOVAR人类各个数据库变异注释结果表格说明

...omim_201806 孟德尔遗传病数据库注释 cosmic70 人类癌症体细胞突变影响的数据库,COSM开头为ID可到网站查询https://cancer.sanger.ac.uk/cosmic CLNALLELEID the ClinVar Allele ID CLNDN ClinVar's preferred disease name for the concept specified by disease identi...

文章 IF=8.78|非肿瘤数据挖掘思路(GWAS Catalog)

...ure数据挖掘-糖酵解IF=6.58|铁死亡相关lncRNA预测头颈部鳞状细胞癌预后文献解析

文章 IF=13.80 | 岗巴羊胃肠道微生物群落动态变化及其在植物生物量降解中的功能分析

...能的影响。 图4:胃肠道微生物组的功能概况  5.植物细胞壁分解关键酶的表达 在对甘巴羊肠道微生物群进行研究时,发现GH5、GH10、GH43、GH48、GH51、PL1、CE2和CE15等酶基因的高拷贝数,表明这些酶在降解植物多糖(如纤维素、...

文章 perl数学函数

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文章 ggplot2控制百分比坐标

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文章 rank秩序(R语言)

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问题 WGCNA中过滤低表达量(0.5)时datExpr0=datExpr0[1:n,datExpr0[n+1,] > meanFPKM]不成功,且变量从上步30769变成了0. ?

...]这步运行始终不成功,也不报错,变量变成了0.请问这是怎么回事?谢谢

问题 gwas脚本中的tassel计算变异位点p值的命令中,结果会自动过滤掉indel,如何保留indel,并计算其p值?

...时候,会自动过滤掉indel。我想同时计算indel的p值,需要怎么做?代码如下: run_pipeline.pl -Xmx30G -fork1 -h hapmap.ordered.hmp.txt \     -fork2 -t $tassel_trait -fork3 -q $structure -excludeLastTrait \    -combine5 -input1 -input2 -input3 -intersect -FixedEffectLMP...

问题 perl脚本去除重复的hmmer搜索的转录本ID为一行,且结果ID是蛋白序列ID。

...为完整序列信息)     因此,为了去除重复,我应该怎么该我的文件?

文章 FigTree进化树批量修改ID

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文章 R语言绘制差异表达火山图

...e/work") data<-read.table("Volcano.txt", header=TRUE,sep = "\t") 数据格式如下(表头不要改): ID FDR log2FC sign Trans_newGene_1010 0.1719571 -0.327617885 NA Trans_newGene_1013 9.65812E-10 -0.905601526 NA Trans_newGene_1014 0.268121627 0.212668419 NA Trans_newGene_1026...