问题 蛋白三级结构分析时，用PSI-blast和SWISS-MODEL自带的模板同时做了，发现SWISS-MODEL自带的模板做出来的相似度更高、GMQE和QMEAN值也更好，同时，两个方法也有重复的模板，想问问老师应该选择相似度更高的，还是选择两种方法都有的模板？

文章 mysql 查询select语句汇总

...ere 列 = any() 括号中任意一个 all(): where 列 = all() 列匹配里面所有 在一个select语句中嵌套另一个select语句 子查询分为: 标量子查询：子查询返回一个数据（一行一列） 列子查询：子查询返回一个列(多行一列)...

问题 单倍型结果的解读

hapVsPhenos.pdf，老师，您好，请问这个单倍型分析结果中，有关于表型和单倍型之间的关联分析，这个左边的热图代表的意思是每个单倍型之间的相关性，怎么判断具体是哪个单倍型和表型是相关的呢？

问题 基因共线性

最近在做基因共线性时，已经准备好GFF文件，调蛋白序列时出错，仔细看蛋白fa文件发现名称不一样，请问怎么解决

文章 北京2例鼠疫确诊，实验小鼠安全吗？

...么凶猛。 但是目前，鼠疫在我国非常非常少见，大家也不必恐慌。 国家疾控中心官网发文称，“北京市民不用过度担心感染鼠疫风险，此次疫情进一步扩散的风险极低。市民可正常工作、生活和去医疗机构就医，不用担心感...

文章 TCGA癌症和正常组织中的基因表达差异图

TCGA数据，做完差异表达分析，获得差异表达的基因之后，可以将差异表达的基因在癌症和癌旁中的数据拿出来进行比较一下，看看两者差别是否显著。 # 绘制差异表达基因在比对样本中的表达情况 # 将表达量进行log2 转换 normDat...

问题 biolinux

导入之后设置的时候发现无效设置。 显示硬件配置页中已启用硬件虚拟化，但主机并不支持，需要禁用硬件虚拟化才能启动虚拟机。是什么意思？怎么处理？谢谢解答

问题 提取保守结构域

我做的的家族分歧比较大 ，需要用结构域建树，不知道怎么操作，希望老师能详细说下

问题 vlookup使用

老师您好，我做PPI图时，按照视屏教学中的步骤使用的vlookup，但筛选不出结果，请问是excel的问题还是其他什么原因？

问题 xpclr绘图

染色体号不一致，参考基因组的染色体号是NC开头，xpclr是数字，与把染色体替换成一致吗？

问题 群体遗传进化分析课程中，如下图所示利用run_pipeline.pl -Xmx5G -importGuess $workdir/00.filter/clean.vcf.gz \ -ExportPlugin -saveAs supergene.phy -format Phylip_Inter这个代码并没有在01.phylo_tree文件夹中得到supergene.phy的文件

文章 一个预测基因保守结构域网站

今天跟大家分享一个分析蛋白保守结构域的的网站： 网址：http://www.ebi.ac.uk/interpro/ 在上图的方框导入蛋白序列，点击submit，就开始运行，结果如下图所示： 这个网站优点就是不仅分析了蛋白的保守结构域，还给出了他的...

问题 老师好，在基因家族分析课程视频里，鉴定基因家族成员时，里面实操用的是基因组的蛋白质序列（pep文件），然而我自己的实验数据是无参转录组，我想问下，我应该用什么文件来鉴定基因家族成员呢？我看到之前有类似问题的答案是unigene或者蛋白质序列，两者有什么区别呢？

基因家族成员鉴定

文章 enrichGO_pip.r GO富集分析

使用说明 Rscript $scriptdir/enrichGO_pip.r  -husage: /work/my_stad_immu/scripts/enrichGO_pip.r [-h] -g gene.list [-d ann.db]                                                 [-t idtype] [-s show.type]                                              ...

问题 TBtools报错

想在tbtools中制作基因结构图，结果因为发育树中将基因ID改成WRKY1,WRKY2对应不上报错了，请问如何解决呢