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文章 linux中 利用rename 批量重命名文件 批量文件改名字

...外的任意字符+ 匹配前一个字符一次或多次 例如,"zo+"可以匹配"zoo",但不匹配"z"[a-z] 表示某个范围内的字符,例如,"[a-z]"匹配"a"与"z"之间的任何一个小写字母字符。[^m-z] 否定的字符区间。与不在指定区间内的字符匹配# Per...

问题 安上了EPIC又遇问题了,老师您有时间了帮我看下。

python的可以用,perl的是这样显示的。

问题 《微生物多样性数据分析实操》课程资料的下载

已经购买了《微生物多样性数据分析实操》课程。该课程相关的数据、脚本等资料有链接可以下载吗?我没有使用docker软件,所以咨询有没有下载地址,谢谢!

问题 各位老师好,我要分析的基因家族没有fa. pep. gff3. 和cds文件,请问还有其他办法进行分析吗?

NCBI中只有fna.和gbff,其他的网址没有这个物种,真的不知道怎么做了,球球各位老师帮帮忙。

问题 lncRNA测序,如何把四种RNA分离,或者只提取mRNA

老师,我的样本测的是lncRNA测序,但是下游只想分析mRNA,请问有没有什么软件可以把mRNA、lncRNA、circRNA分开,或者只把mRNA提取出来,用于后续分析?

问题 关于RNAseq的docker分析中获取基因长度报错问题

...neL[kvs['gene_id']]:KeyError: 'gene_id'gtf如下:请教老师如何解决这个问题,不胜感激!

问题 非模式物种功能注释与GO KEGG富集分析遇问题

...染色体吗?。查看了输出的protein_coding_discarded.txt文件,这个文件里基本都是gene-biotype不是蛋白质编码的。

文章 紧扣前沿热点--多种研究培训,总有你需要的!

...衡的生信学习方式,是大部分人的最优选择: 赶紧利用这个暑期,来组学大讲堂掌握生信技能吧!! 组学大讲堂直播课程特点: ①课程针对0基础学员设计,半自动化分析; ②采用docker虚拟机技术,不同操作系统保持...

问题 [main] unrecognized preset 'china-wild-ibex-clean.recode.vcf.gz'

我用命令过滤后vcftools --gzvcf china-wild-ibex-clean.vcf.gz --max-missing 1.0 --recode --stdout | gzip -c > china-wild-ibex-clean.recode.vcf.gz  在去建立索引tabix -p china-wild-ibex-clean.recode.vcf.gz 这个文件出现下面的错误是怎么回事?

文章 《转录组代谢组个性化数据分析》课程上架

...为你量身打造通往科研成功的捷径! 课程适合学员:拿公司给的结果后看不懂结果,不知道如何整理数据发表文章。针对以上 转录组代谢组个性化数据分析视频课程:  转录组和代谢组是生物体内基因表达和代谢活动的反...

问题 老师你好 我在进行保留最长转录本的时候报错

根据微信群里水稻泛基因家族文章的链接点进网页下载相关的gff文件 然后解压 查看文件内容 前面处理都可以  进行保留最长转录本的时候出现以下警告和报错 并且生成的gff文件是空的 

文章 获取关系矩阵(WGCNA)

...多步计算 但是如果想要关系矩阵呢?基于什么样的代码可以获得关系矩阵?并且不拘于WGCNA中? 可以基于cor 或者corAndPvalue(注意提前加载WGCNA包,否则函数无法使用) 案例数据:dat1 > dat1                 A    ...

问题 Fasttree建树失败,报错不是核苷酸序列?只能完成73%

老师您好,我在fasttree建树时遇了这样的问题,一共是566个个体,之前用其中的328个个体建树时是成功的,增加后就不可以了,用我们的服务器试过了,报了同样的错 请问是什么原因呀?

问题 在使用R语言read.table的时候,一直提示“'row.names'里不能有重复的名字”

...a_file, header=TRUE, stringsAsFactors=FALSE,row.names = 1) 文件大概是这个样子的,就是按照课程中的基因表达量提取的方法得的文件 我知道他的意思好像是第一列有重复的数值,但总共有超过20000行,我不可能一个个排查,想请问各位...

文章 R 删除重复数据

...第5行的数据重复,所以,返回值的第8和第9是TRUE,因此,可以按照如下操作,排除为TRUE,就是重复的数据,只取数据第一次出现的结果。   dat[!duplicated(dat),]   A B C D1  a b a c2  c k b d3  c k c c4  d e q k5  e f g ...