...外的任意字符+ 匹配前一个字符一次或多次 例如,"zo+"可以匹配"zoo",但不匹配"z"[a-z] 表示某个范围内的字符,例如,"[a-z]"匹配"a"与"z"之间的任何一个小写字母字符。[^m-z] 否定的字符区间。与不在指定区间内的字符匹配# Per...
python的可以用,perl的是这样显示的。
已经购买了《微生物多样性数据分析实操》课程。该课程相关的数据、脚本等资料有链接可以下载吗?我没有使用docker软件,所以咨询有没有下载地址,谢谢!
NCBI中只有fna.和gbff,其他的网址没有这个物种,真的不知道怎么做了,球球各位老师帮帮忙。
老师,我的样本测的是lncRNA测序,但是下游只想分析mRNA,请问有没有什么软件可以把mRNA、lncRNA、circRNA分开,或者只把mRNA提取出来,用于后续分析?
...neL[kvs['gene_id']]:KeyError: 'gene_id'gtf如下:请教老师如何解决这个问题,不胜感激!
...染色体吗?。查看了输出的protein_coding_discarded.txt文件,这个文件里基本都是gene-biotype不是蛋白质编码的。
...衡的生信学习方式,是大部分人的最优选择: 赶紧利用这个暑期,来组学大讲堂掌握生信技能吧!! 组学大讲堂直播课程特点: ①课程针对0基础学员设计,半自动化分析; ②采用docker虚拟机技术,不同操作系统保持...
我用命令过滤后vcftools --gzvcf china-wild-ibex-clean.vcf.gz --max-missing 1.0 --recode --stdout | gzip -c > china-wild-ibex-clean.recode.vcf.gz 在去建立索引tabix -p china-wild-ibex-clean.recode.vcf.gz 这个文件出现下面的错误是怎么回事?
...为你量身打造通往科研成功的捷径! 课程适合学员:拿到公司给的结果后看不懂结果,不知道如何整理数据发表文章。针对以上 转录组代谢组个性化数据分析视频课程: 转录组和代谢组是生物体内基因表达和代谢活动的反...
根据微信群里水稻泛基因家族文章的链接点进网页下载相关的gff文件 然后解压 查看文件内容 前面处理都可以 进行保留最长转录本的时候出现以下警告和报错 并且生成的gff文件是空的
...多步计算 但是如果想要关系矩阵呢?基于什么样的代码可以获得关系矩阵?并且不拘于WGCNA中? 可以基于cor 或者corAndPvalue(注意提前加载WGCNA包,否则函数无法使用) 案例数据:dat1 > dat1 A ...
老师您好,我在fasttree建树时遇到了这样的问题,一共是566个个体,之前用其中的328个个体建树时是成功的,增加后就不可以了,用我们的服务器试过了,报了同样的错 请问是什么原因呀?
...a_file, header=TRUE, stringsAsFactors=FALSE,row.names = 1) 文件大概是这个样子的,就是按照课程中的基因表达量提取的方法得到的文件 我知道他的意思好像是第一列有重复的数值,但总共有超过20000行,我不可能一个个排查,想请问各位...
...第5行的数据重复,所以,返回值的第8和第9是TRUE,因此,可以按照如下操作,排除为TRUE,也就是重复的数据,只取数据第一次出现的结果。 dat[!duplicated(dat),] A B C D1 a b a c2 c k b d3 c k c c4 d e q k5 e f g ...