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文章 Excel数据分析技巧之双因素方差分析

...”表示的是PH值，“列”表示的是温度处理时间，从结果中可以看出不同的PH值对种子萌发率有极显著的影响，而温度处理的时间长短对种子萌发率没有显著的影响。（当F＞Fcrit，表示有显著或极显著差异；当P-value＜0.01，表示有...

文章 Excel数据分析技巧之双因素方差分析

...”表示的是PH值，“列”表示的是温度处理时间，从结果中可以看出不同的PH值对种子萌发率有极显著的影响，而温度处理的时间长短对种子萌发率没有显著的影响。（当F＞Fcrit，表示有显著或极显著差异；当P-value＜0.01，表示有...

文章 R安装报错：configure: error: --with-readline=yes (default) and headers/libs are not available

...了正确的 readline 库路径。可以使用以下命令来查看系统中的 readline 库路径：$ rpm -ql readline | grep libreadline.so如果 readline 库已经安装，则会显示 readline 库的路径。在编译软件时，您需要使用 --with-readline 选项来指定 readline 库的路...

文章 微生物互作网络构建教程网站--Microbial association network construction tutorial

基于微生物16s测序数据中的OTU丰度矩阵可以进行微生物互作网络构建，从而探索微生物之间的互作关系。而网络的构建方法多种多样，下面给大家推荐一个网站，Microbial association network construction tutorial （打开链接可以点这里）...

文章 bio-linux安装包下载链接

...载链接：https://pan.baidu.com/s/1ui9ndOsjbtgHrJoxxOcTMQ  日常科研中你我经会常遇到看不懂的图表，不会挖掘的数据，没有思路的文章，沟通不畅的个性化分析，求人不如求己，一切痛点都能解决： 1. 单细胞/空间转录组正在大火，高分...

文章 出众的进化树注释软件Evolview

...绘制进化树， 绘一棵超酷炫的系统发育树  和  进化树中如何体现分组，这里再推荐另一款同样非常好用的进化树在线绘制软件——Evolview。 Evolview简介 Evolview是一款在线进化树注释软件，能够实现很复杂的注释效果，且用...

文章 《Nature》发文描述几百万年间柑橘如何从喜马拉雅山到我们的餐桌

...之一，虽然科学家早就知道柑橘树来源于亚洲。例如，在中国西南部发现的一片柑橘叶化石显示，这个地区在800万年前就存在一个共同的祖先。但是，至今为止，所有柑桔如何传播和多样化以产生今天的品种，这仍是一个谜。加...

问题 NGS数据分析时，使用ANNOVAR的table_annovar.pl报错。

使用自建数据库。用ANNOVAR的annotate_variation.pl进行注释时，没有报错。 [*****@head ****]$ perl ../tessDSS/annovar/annotate_variation.pl -geneanno -buildver HP ./bin/M5-31.avinput HPdb/NOTICE: Output files are written to ./bin/M5-31.avinput.variant_function, ./bin/M5-31.avinput....

文章 多图对比在腾讯、阿里、字节跳动的工作区别?

...花光一辈子的运气； 字节跳动：每年两次，晋升面试不用 ppt。 内部称呼 腾讯：员工起英文名，例如 Gangdan Wang= 王钢蛋； 阿里：花名，例如矮大紧 = 高晓松，还有尼玛、土豪、呵呵、蛋疼等奇葩花名； 字节跳动：直接叫...

问题 关于基因组功能注释脚本（interproscan.sh -i interproscan.pep.fa \ -b interproscan.out -f "TSV" \ -cpu 10 -dp -t p -pa -goterms -iprlookup \ -T ./tmp ）运行不成功，总是停留在84% completed，没有报错，请问要怎么解决？

再次进入容器时是卡主的。log中每小时更新一条信息，均为84% completed，tmp文件夹中不再更新文件。独享服务器（内存300G，28线程），设置了cpu=10，线程数=10

问题 重复序列分析，去除含有基因序列的库文件时候报错，你们示例数据也有这样的问题

...8.0_linux_x86_64, 503.4GB RAM, 128 cores 我看了你们示例输出文件中的Homology.db_blast_results.txt.fnolowm50seqmGC，发现输出都是： A C G T N totalnoN total00000000 00000000 00000000 00000000 00000000 00000000 00000000AT 00000000 GC 00000000 明显你们的示例数据也计...

文章 picrust2用法

#去掉序列ID中注释信息，避免错误：no ASV ids overlap between input FASTA and sequence abundance table get_fa_by_id.pl $workdir/5.pick_otu_qiime/pick_de_novo_otus/otu_table_clean.txt $workdir/5.pick_otu_qiime/pick_de_novo_otus/rep_set/qiime_rep_set.fasta rep_set.farm -rf picrust2_out...

文章 提取合并基因家族的domain序列

在做基因家族分析中，使用hmmsearch搜索到结构域后，如果基因有多个domain，并且需要将所有domain提取连接在一起，可以使用下面的脚本完成。 使用方法： 命令如下： perl   domain_hebing.fa.pl   hmmsearch.out.txt   Arabidopsis_thaliana.TAIR1...

文章 ggplot2几个主题类型

..._get()      theme_linedraw() ....等等，具体在在RGUI 或者Rstudio中查看 如果想提升自己的绘图技能，我们推荐：R语言绘图基础（ggplot2) 更多生物信息课程： 1. 文章越来越难发？是你没发现新思路，基因家族分析发2-4分文章简单...

文章 wgd syn 报错 KeyError: 6.0

..._list_x] + x for x in KeyError: 6.0 wgd_cli.py程序bug，如果GFF中染色体名称全部是数字，会读成数字，导致出错