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文章 Excel数据分析技巧之双因素方差分析

...件--选项--加载项--转到--加载宏--分析工具库--确定。具体可以参考Excel数据分析技巧之方差分析。  02  打开excel表（版本为 Excel2010），输入需要分析的数据，本次演示的数据是温度和PH值对水稻种子萌发率的影响。在这里，...

文章 合并不同sample的vcf文件，通过bcftools

...i-sample的，这里就需要我们将不同samples的文件进行合并，可以通过vcftools的perl模块进行，但是这种方式对perl的要求较高，且操作比较复杂，这里我们选择使用Bcftools，操作简便。 分三步：   将vcf进行压缩，批量压缩的方法...

问题 有多个时期的转录组数据，如何进行基因注释

老师好，想问下如果有多个不同时期的转录组数据，在03.Braker.sh中，是分别进行比对获得bam文件，然后在braker.pl中输入多个bam文件吗？是的话，gff3文件可以是各个文件cat一起吗？还是有其他操作？

问题 购买的《群体遗传进化》新更新的课程怎么观看

...想学习新更新的两节课程，请问该怎么学习？有什么渠道可以开放观看这部分内容吗？

问题 群体遗传进化分析 W文件中的PCA代码 出现bug

按着视频里面操作但是 无法运行，只要是和plink有关的都不行，  进化树可以正常运行

问题 pi_smooth_line_plot.r作图问题

您好，课程中讲解的是将示例数据中的wild和cultivated两个文件分开作图的，请问可以将两个文件作到一张图么？

文章 低成本转录组跨种遗传进化分析

...，全基因组测序困难;因此 RNA-seq是相对经济的选择，因为可以低成本获得大量的序列用于分析。 数据分析       作者取A. aureum and A. speciosu 的幼嫩叶片进行无参转录组测序，denovo分别组装构建unigene库；并对unigene库进行...

问题 用TBtools做基因结构，使用他人电脑同样的数据能做出来，但我的电脑就是做不出来

用TBtools做基因结构，已更新到最新版本，使用他人电脑同样的数据能做出来，但我的电脑就是做不出来。请问各位老师应该怎么解决 7月 20, 2022 5:28:57 下午 biocjava.GUIexcutors.JIGplotToolkit.AmazingGeneViewGUIPanel$19$1 run 严重: null java.lang....

问题 老师您好，看了您的《pacbio 三代全长转录组数据分析流程 Iso-Seq 3》文章，想请教一个问题

我用lima处理三代测序的数据总是这个报错误，您知道怎么处理吗？

问题 基因组重测序，排序完后进行去重复总是被Killed

这样是哪里有问题啊老师，有些可以正常的进行，有些不行。

文章 CommandNotFoundError: Your shell has not been properly configured to use 'conda activate'

使用conda时报上面的错，一般是因为路径错误 使用这个命令获取路径 conda info | grep -i 'base environment' 用得到的路径替换下面命令中的路径 source 路径/etc/profile.d/conda.sh 运行之后conda的使用就正常了

问题 clustalW构建出来的系统发育树打不开是什么原因？

文件名后缀是.phb的，在mega里面打不开。但是可以打开.dnd的？请问为啥呢，谢谢

文章 libgomp.so.1: version `GOMP_4.5' not found 报错

...data.table所需的GOMP_4.5符号版本。 解决方法将新的库加到环境变量里： export LD_LIBRARY_PATH=/share/work/biosoft/R/R-v4.2.2_meta/lib64/R/library/:$LD_LIBRARY_PATH

问题 关于基因芯片affy包rma标准化

看了GEO芯片数据标准化的视频，关于affy包，请问如果后续分析需要未进行log转换数据，那我可不可以对rma处理的数据进行2^x进行反对数转换？还是应该直接用mas5.0标准化？

问题 circos作图时用到的links.txt要如何得到？

已经使用MCScanX做了共线性分析得到了collinearity和tandem文件，但我用命令的水平太菜调不出links.txt格式，请问有没有可以用的脚本或者工具之类的？