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文章 在凤蝶属基因组中的基因进化分析和水平基因转运(HGT)模式

...OG与物种间ABC基因的存在与否矩阵图，根据图D气泡的深浅可以看出，ABC转运蛋白家族在不同物种间从存在/缺失差异明显。 根据图C图D结果，表明某些物种在分化后经历过ABC转运蛋白基因家族独特的进化事件。 更多生信课程：...

问题 提取vcf文件中的信息

...件的一些snp信息都被plink简化了，不知道有什么好的办法可以去除scaffold行，请教老师们了。

问题 snp密度图绘制

...片则正常输出，请问老师，这样得出的结果是一样的吗？可以这样吗？

问题 利用Heatmapper在线网站绘制基因编号时不显示基因ID，只显示数字1，2，3...

...样本名称，第一列基因ID名的格式整理了，请问如何解决这个问题？

问题 基因家族分析时，提取cds与pep序列报错显示 no sequence

Error, no sequence for Scaffold1 at /share/work/biosoft/TransDecoder/latest/util/gff3_file_to_proteins.pl line 84. 应该如何解决？代码与报错如下， 我的基因组gff文件是这样的，我看课程示例文件是ID=XX;Parent=xx,是因为这个才提取不出来吗

问题 SeparateChromosomes2划分连锁群不合理怎么解决

...理发现，同一条染色体上的bin划分在各种不同的连锁群。这个问题该怎么解决呢。

问题 在win7系统的文本里用快捷键ctrl+c复制了命令，但在bio-linux里却黏贴不了。求解。

重新下载了新的bio-linux，导入虚拟机，在终端进行操作，结果win7系统的文本中复制的命令，没法黏贴到bio-linux系统的终端里。不知道是哪里出了问题。求解答。

文章 单细胞转录组数据标准化：

...乘以缩放因子（默认为 10,000）。结果是将每个细胞缩放到总共 10k UMI，以避免样品中不同细胞类型不同测序深度的影响。然后，NormalizeData 添加伪计数 1（以避免转录零值），并获取每个计数的自然日志。通过这种方式，我们对...

问题 老师能出个无参转录组拼接和分析的视频吗？

最好能详细一些，也讲一讲一些冷门物种的分析手段，是否可以考虑？

问题 一次搜索多个结构域

...haliana.gene.pep.fasta”； 对于ring finger这种pfam众多的家族，可以一次性把所有pfam一起做出来吗？还是一次只能搜索一个然后手动把搜索出来的所有序列和ID合在一起？谢谢老师解答！

问题 如何合并两个提取好的两个保守结构域的序列

一个基因家族的每个基因两个不同保守结构域，现在要怎么给它们合并啊，手动吗，还是可以通过命令实现呢

文章 Excel数据分析技巧之双因素方差分析

...件--选项--加载项--转到--加载宏--分析工具库--确定。具体可以参考Excel数据分析技巧之方差分析。 02  打开excel表（版本为Excel2010 ），输入需要分析的数据，本次演示的数据是温度和PH值对水稻种子萌发率的影响。在这里，我...

问题 不能使用scripts中的vcf2map.pl脚本

... perl script "/work/scripts//vcf2map.pl": No such file or directory 切换到scripts中授权chmod a+x vcf2map.pl后再回到01.PrepareData运行上述命令还是不行 使用绝对路径 perl /work/scripts//vcf2map.pl -i ../00.DataQC/all.snp.ready.vcf.gz -P TD70 -M Kasalath -Pd 10 -Md 10 -o pop...

问题 关于微生物群落功能注释-FAPROTAX数据库介绍及使用

这篇文章中的第4步进入虚拟器始终不能成功，可以教学么？

问题 获得基因的在染色体上的外显子，CDS，UTR位置信息，用于绘制基因结构图时，提取的文件是空文件？是怎么回事。

查看Triticum_aestivum.IWGSC.42.gff3 Terpene_synth_C_domain_new_out_removed_redundant.txt 这两个文件也没错误