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问题 老师,我用mapman对非模式作物进行基因通路注释,通过esembl biomart获得每个基因氨基酸序列,然后去官网制作mapping文件,在mapman软件进行注释,过程没有出现问题,也出了图,但是我点开某一通路,想看看有哪些基因的时候,我发现底下的基因注释与图中位置是一致的,例如图中的ABA、JA,底下的Binname应该是和他们没有关系的吧?请问这是怎么回事

问题 老师我做存在缺失分析部分,Fam_gene.list中泛基因编号为什么是连续的呢

老师我做存在缺失分析部分,awk -F"\t" '{if($0!~/^Fam_N/){for(i=2;i<=27;i++){print $1"\t"$i}}}' PAV_gene.list |sed "s/;$//"|awk -F"\t" '{gsub(";","\n"$1"\t",$0);print}'|awk -F"\t" '{if($2!=""){print}}' > Fam_gene.list这一步,得到的泛基因编号为什么是连续的呢?...

问题 TCGA生存分析中表达数据只有肿瘤数据吗?我自行下的TCGA数据是是需要把肿瘤病人提取出来,排除癌旁?

问题 请问各路大神,KDA分析(key driver analysis)用R语言,加包在哪里?我在CRAN和bioconductor都没有找到。

问题 网络分析中在MENA中做出环境因子和OTU之间的联系之后,怎么在Cytoscape中可视化呢?谢谢老师

就是这些步骤完成之后如何可视化,https://www.omicsclass.com/article/558

问题 宏病毒组得到的contig如何做系统发育分析,包括如何选取合适的序列?contig是否需要截取相应的基因片段?如何截取?

问题 老师,请问在进行共线性分析时,出现ValueError: A total of 0 anchor was found. Aborted.是什么原因呀?

问题 做Ka/Ks分析时,有两对片段重复基因,一对Ka/Ks值大于一,另一对小于一,这该怎么解释呢?

问题 在进行structure分析时,我按照步骤一直做,然后做图那步骤时候,显示没有这个输入文件,想问问问题出在哪里?

问题 泛基因家族分析,提取CDS序列结果如图所示,并且文件大小只有38KB,是是这个基因组就能用了

问题 老师,我在分析PSMC时,出现无法查找到染色体名称,fa文件里面的命名是这个样子的,该怎么办啊

问题 请问在做SSR分析用circos,会显示配置文件报错要怎么解决呢,完全粘贴课程内容中的conf配置文件

问题 老师好,我在做gwas分析小麦时,按照脚本进行vcftools 过滤生成clean.vcf.gz 文件后出现以下问题,该如何解决

问题 基因家族大概四十个基因,GO富集分析只有CC组数据正常吗?阈值调到0.1也依旧只有CC组

问题 关于TCGA的下,学了课程还是遇到点问题,求老师指点

...代码也没问题。但是自己实操中,遇到情况就有点复杂,会用了。 我是要结肠癌和直肠癌,并且要腺癌的样本数据,有点复杂,这是我网页筛选条件,代码知道怎么写。 看了论坛里老师筛选原发位点的帖子 我想先根...