问题 TBtools安装包在基因家族分析课程的软件里没有，下载链接也没有，请问这样的课程是不是还有改进的地方

问题 老师您好，我在做基因家族共线性分析时出现了以下问题，您能给我答复一下吗，谢谢老师，祝您生活愉快！

问题 请问做基因组内共线性分析时，下图中的“genome.blocklink.txt”文件如何配置？（它代表图中的灰色部分）

问题 老师你好，问一下如果所做物种只有基因组数据，没有转录本，CDS等文件，该用什么软件分析得到别的数据

问题 老师您好，做基因家族鉴定分析时如何将网站上筛选的基因家族与自己的转录组鉴定得到的基因家族融合在一起？

问题 老师，您好，GATK4.1 mutect2寻找体细胞突变没有正常样本panel，可以进行体细胞突变分析吗

问题 老师，群体进化分析中做进化树的时候，VCF转换成phy文件，输入命令以后没有任何输出文件，自动中止了。

问题 请问老师，用多个物种的转录组pep数据可以进行比较组学中基因家族聚类、扩张收缩等的分析么？

问题 我得到转录组分析的wgcna数据需通过cytoscape筛选关键模块的hub基因，边的权重应该设定多少来筛好

问题 pav分析，在写文章的时候应该如何写怎么到PAV呢？我是通过课程输入代码来的，写文章怎么写呢？

问题 老师您好，我用orthofinder2跑出来的多序列比对文件总是空的，导致后面分析报错，这个该怎么解决呢老师。

问题 用pfam搜到的基因构建进化树报错

...域，那么，如果删掉这几条基因建树，基因家族的鉴定是不是就不完整了？不删除的话，如何建树？

问题 老师，求助，转录组差异表达基因分析报错

Rscript $scriptdir/deseq_analysis.r -i $workdir/4.expression/all_gene_count.tsv -g S3_vs_S4.compare.txt  -k $workdir/4.expression/all_gene_fpkm.tsv -r S3 --fdr 0.01 --fc 2 -p S3_vs_S4 Loading required package: ggplot2 Loading required package: edgeR Loading required package: limma [1] "abstra...

问题 我在使用SSR引物设计时，使用课程视频里面的脚本和示例文件，跑出来的结果文件里面是空的，提示好像是路径的问题？

...发现视频里的镜像omicsclass/reseq是8.76G,目前镜像更新后的版本是13.8G,会不会是镜像更新后出现了Bug，希望能够得到解答，错误提示在文字最后面。 SEQUENCE_TARGET=201,10 SPRIMER_TASK=pick_detection_primers PRIMER_PICK_LEFT_PRIMER=1 PRIMER_PICK_RIGHT_...

文章 PBJ：转录组揭示植物中磷再转运的分子机制

前言 只针对一个具体的小问题，利用RNA-seq进行分析也能发高分文章？当然可以！ 这次跟大家分享的文献就是针对水稻旗叶中磷的再运转问题开展的实验(发在Plant Biotechnology Journal上），利用RNA-seq数据分析相关基因的表达情...