...员 利用从Pfam数据库下载的 raw NBS HMM 在木薯基因组数据中鉴定NBS基因，再用这些基因构建木薯特异的 HMM模型，然后使用新建的 HMM模型重新搜索木薯NBS基因家族成员，这样才能得到比较全面的NBS基因家族成员。流程如下图所示...
...题是“如何做转录组分析？”，内容是：“如题”）问题中完全没有自己的观点，也就是传说中的伸手党。伸手党的存在主要有两大害处，第一，你没有说出已经尝试过哪些方法，没有尽量为回答者排除错误情况，会大大降低回...
下面命令中用到的qtlplot怎么下载，从哪里下载安装到服务器上，不使用docker的情况下 qtlplot -v qtlseq.RS-blast.clean.vcf.gz -r HitomeboreWT --bulk1ID S-bulk --bulk2ID R-bulk --N-bulk1 20 --N-bulk2 20 -m 0.3 --out qtlseq_SR-blast
...是至少两种计算方法显著才会留下这组数据，但在Cytoscape中展示网络中依旧留有只有一个方法计算显著，请问原因是什么？如何解决？ 再一个问题就是用Gephi可视化的，导出的边的数据中显示关系强弱的就是用的“weight”这列...
...体的文件格式，根据文件格式去准备文件。比如，染色体中基因涉及正负链的信息，如果不能一次性消化AI给的回答，可以分布提出需求，理解了之后再对脚本进行加工处理。最终得到如下的回答，回答分为4部分：1输入文件格...
...需要按一下热键，鼠标就会解除独占状态。热键一般是右Ctrl键，在 界面的最右下角有显示。 或者在用户界面的热键里，点一下鼠标集成，这样鼠标就可以在虚拟机与物理机间自由切换。 此外，我们在网易云课堂上有各...
随着测序技术越来越成熟，转录组测序研究中，RNA制备已经逐渐成为限制我们科研僧发表SCI的绊脚石。 众所周知，mRNA占比少又易降解，万一降解了，又得千辛万苦的重新制备样品，真的是为此伤透了脑筋. 今天就跟大家分享下...
...rect 错配校正 校正是使用参考基因组来鉴定和校正contigs中的组装错误，该步骤不会将序列减少或增加，仅仅是将序列在错误组装的位置进行打断。 ragtag.py correct <reference.fa> <query.fa> 2. scaffold 将相邻的contigs序列用1...
...，回头来看，这个实验设计并不复杂，内容也不是过多，为啥人家能发表而你却被拒稿呢？要知道，就这个2区3.5分影响因子的BMC Genomics ，也是很多人渴望而不可得的存在。 2020年，转录组类文章到底有多难发？从这篇文章我...
...牛人差在哪里？ 你眼中的学术大牛是什么样子？灵光的idea？精湛的实验技术？其实给你留下更深印象的是他们的财大气粗，高深莫测的数据挖掘能力以及论文里美轮美奂的学术图片！ 没错成为大牛绝非偶然，是每个人凭借自...
野生型亲本，抗性混池，用gatk生成gvcf，再转为VCF，筛选出SNP。直接运行：vcftools --gzvcf merge.snp.vcf.gz --recode --recode-INFO-all --stdout --max-missing 1 --minDP 4 --maxDP 1000 --minQ 30 --min-alleles 2 --max-alleles 2 |gzip - > merge.snp.clean.vcf.gz；m...