问题 基因家族分析的蛋白结构预测，怎么比较预测的不同亚类蛋白3D结构的相似性？

还有就是如果同一家族的蛋白结构是相似的，因为是3D，怎么让几个结构相似的蛋白放在一起的图片中，不同蛋白都展现的事相似结构的那面

问题 请问我把命令放后台，然后电脑关机想第二天在做的话，命令可以在后台一直继续分析吗

问题 请问一下动植物比较基因组的课程适合酵母基因组真核的基因组比较分析吗？？？

问题 #16S 分析 deblur的方法应用时报错，如下图，前面的数据是严格按照视频进行的，请老师解答

问题 共线性分析进行blast+比对，输出屏幕出现waring，这是啥意思啊?影响比对结果吗？最后能输出blast文件

问题 进行阿尔法多样性分析是报错

for i in  goods_coverage  observed_species PD_whole_tree  shannon simpson;do        alpha_compare_stat.r -i alpha_div_index.txt --index $i \             --group Group -f $fastmap -o alpha_diversity_stat         alpha_compare_plot.r -i alpha_div_index.txt -I $i -f $fastmap   \ ...

文章 OthroFinder-物种同源基因分析工作原理

Orthofinder是做直系同源基因分析时常用软件，除此之外，还可以使用OrthoMCL，今天主要介绍Orthofinder软件的工作流程。 1. Orthofinder发表的工作流程如上图：     1.1 （a）将所有物种的全部蛋白序列通过序列比对和调用MCL聚类实...

文章 corrplot包绘制相关性图，简单又好看！

相关性分析作为一种强大的工具，能够帮助我们量化变量间的关联程度。R 语言中可以做相关性矩阵可视化的包有很多，小编最喜欢用的还是corrplot 这个包。 corrplot包非常容易使用，并在可视化方法、图形布局、颜色、图例、文...

问题 基因家族分析文章：筛选时为什么选用基因组数据库的编码蛋白，而不是蛋白组数据库？

各位老师，我基因家族分析的文章被审稿人问道：It is not clear to me why authors search protein from the genome, not proteome. Moreover, the authors should underline that their results report the finding of candidate genes encoding protein and not ...

问题 老师，我们之前在NCBI已经上传过一株弧菌的二代测序基因组序列，现在想上传同一株菌的三代测序全基因组序列，想问下老师，Bioproject号是用之前二代序列的那个呢、还是重建一个呢？然后申请完bioproject和biosample后，对三代序列上传的位置有点迷茫，不知道三代序列应该上传至Genome/Genbank/SRA中的哪一个位置？希望老师可以指点指点，谢谢老师。

问题 16S课程 02.feature_table #16S 分析 deblur

运行代码报错 #16S 分析 deblur qiime deblur denoise-16S \     --i-demultiplexed-seqs ../01.import_data/demux-joined-filtered.qza \     --p-trim-length 400 \     --p-sample-stats \     --p-jobs-to-start 10 \     --p-min-reads 2 \     --o-representative-sequences deblur-re...

文章 linux无法自动启动

...ot 设置 4.按照下图中设置，然后进入 BIOS Boot Settings; 5.按照下图设置 6.回到BIOS设置界面，进入Miscellaneous Settings界面 7.按照下图设置即可。 重新启动后就可以直接开机了。

问题 老师您好，我用单细胞课程的脚本做轨迹分析，一直报错是怎么回事？报错信息如下：

提示我sample_name那一列有重复的，但我检查了metadata文件，没有重复的啊？

问题 通过blast比对来确定基因家族

...族没有hmm模型我能利用您在： #######################共线性分析，基因加倍与串联重复分析MCScanX这一章节中的blast来分析我的基因家族在特异物种的蛋白序列来进行分析嘛？ 就是利用这个手段来找到我这个基因家族在这个物种对应...

问题 老师，我需要用cufflinks Linux x86_64 binary做表达分析，根据课程安装了虚拟机导入的linux系统

老师，我需要用cufflinks做表达分析，由于windows系统cufflinks下载过于繁琐，所以通过咱们课程下载的虚拟机以及成功导了入linux系统，现在要下载安装cufflinks Linux x86_64 binary。想问一下在虚拟机的Linux系统下怎么安装cufflinks Linux x86_...