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问题 老师我想做GWAS分析找油脂含量及相关脂肪酸的候选基因,可以通过采我要研究的物种的叶片去测序,收集的种子测油脂含量和脂肪酸组成吗

问题 老师,我想问一下,我正在学泛基因家族分析;自己的数据如何上传?是弄成压缩包的形式通过filezilla上传到data文件夹,覆盖之前上传的课程内容吗?

问题 老师,我用perl $scriptdir/vcf2hmp.pl clean.vcf.gz hapmap.txt.gz这个之后用gapit的那些模型分析时总是报错

问题 老师,我用perl $scriptdir/vcf2hmp.pl clean.vcf.gz hapmap.txt.gz这个之后用gapit的那些模型分析时总是报错

文章 挖掘公共基因大数据的时代已经到来

...部分科研工作者一般对自有的实验材料进行数据收集,在分析层面一般仅关注某几个具体的角度,并没有全面的发掘数据的潜力。 大数据挖掘时代 随着大量的数据产生,大规模样本,多组学的复杂数据在公共数据上堆积如山...

文章 linux 硬盘分区 格式化 挂

...行操作,分区,格式化(重点) fdisk:磁盘分区,是Linux发行版本中最常用的分区工具 用法:fdisk [选项] device     常用的选项 : -l 查看硬盘分区表   案例:在sdb盘上建一个分区,大小为1G [root@centos7 ~]# ll /dev/sd*brw-rw--...

问题 您好,我用cytoscape 的BinGO进行GO富集分析时,参照你们提供的无参 GO注释的demo, 怎么运行了?请您指教

这是您的教程,https://www.omicsclass.com/article/339  ,我做的是非模式植物的,用你们的demo,准备GO 注释数据,(species=sss_aa)(type=consortium)(curator=GO) i0_HQ_W_c10162/f2p0/728 = 0015078 i0_HQ_W_c10176/f5p0/771 = 0006457 我这个格式有错吗? 谢谢, 照你...

问题 老师,您好,我正在泛基因家族分析,想问课程中用到的结构变异的vcf文件all_merge.vcf是泛基因组全基因组范围的变异吗,

老师,您好,我正在泛基因家族分析,想问课程中用到的结构变异的vcf文件all_merge.vcf是泛基因组全基因组范围的变异吗,如果作者那边要上,可以要部分的话,我这边是要foxtail_millet.GRASgene.list  文件呢,其中中有5502个(在02....

问题 wgcna

...23。我后面要根据GS>0.2和MM》0.8筛选hub gene,然后做后续分析。黑色的模块还能用来分析吗,是是要舍弃掉。它的cor实在是低,并且P值>0.05。红色模块是是还可以继续分析

文章 最新研究:爱笑的人,论文质量一般会太差......

你一定听说过一句话: 爱笑的女孩,运气一般都会太差....... 这浓浓的非主流气息...... 但是现在,有研究表明,这句话是有科学依据的! 尤其是对于我们科研人原来说,爱爱笑,可能真的和你的科研“运气”有关。 ...

问题 老师您好,请我一下您这里或是哪里有关于WGCNA分析的性状数据准备的详细介绍的资料或课程吗?因为我之前买了您这里的关于WGCNA分析的课程,但是课程里面用到的性状数据应该属于类别性状,用了01转换的,那要是数量性状应该具体是如何准备的我也太理解,我看有人提到说是表达量,我也太理解这个表达量指什么?请问老师有相关课程或资料吗?您这里有篇文章是讲了这两种性状数据,但是描述的有点简单。

文章 同物种基因组之间的比对与可视化

...序列(参考序列)进行比较,寻找相似的区域。 4.结果分析: 分析比对结果,识别共同的序列、结构变化、演化关系等信息。这可能需要使用一些工具和软件来解释和可视化比对结果,例如使用基因组浏览器(如UCSC Genome Browse...

问题 老师您好,我在做物种间共线性分析绘图时,显示list index out of range,我检查了准备的bed文件和cds文件没问题。请问这种情况怎么处理?

问题 按照课程所讲,在 使用docker的rnaseq:latest镜像进行基因分析时,报错显示没有DESeq2; 安装DESeq2包时又显示错误, 有人知道这种情况怎么解决吗?

问题 老师,请教您一个生存分析的问题,为什么phenotype的删失数据天数一列中会出现alive time=0的情况,是病人还没开始实验观察就去世了吗?