问题 老师您好，在跑TCGA生存分析的时候，在进行lapply()的时候一直报错。Error in terms.formula(formula, special, data = data) : ExtractVars里的模型公式不对

问题 一个基因，在实验组fpkm大于1，对照组fpkm小于1,有人说fpkm大于1，为有效表达，我可以把小于1的默认为等于0吗？然后做差异分析

问题 基因家族分析：当GFF文件中首行不是所在的染色体而是一个个基因的GFF文件，这种怎么找对应关系啊，或者怎么整成有染色体的

问题 iqtree2 -s supergene.phy -st DNA -T 2 -mem 8G \ -m GTR -redo \ -B 1000 -bnni \ --prefix iqtree 命令怎么加入外类群分析

问题 请问老师如何看选择清除分析中的选择信号值？怎么判断受选择基因的选择强弱？从基因列表中只能获得基因的位置等信息。

比如在Fst.top0.05.gene.txt中，最后一排的数值（31569）代表是什么意思？ NC_063982.126600013090000NC_063982.1Gnomongene26370752691570.+.ID=gene-LOC105388771;Dbxref=GeneID:105388771;Name=LOC105388771;gbkey=Gene;gene=LOC105388771;gene_biotype=protein_coding31569 这个最后一个...

问题 老师您好我想问一下做GWAS分析，我的物种是异花授粉植物，我要研究它的种子油脂的相关性状，我是用叶片还是用种子的胚更好

问题 老师您好，做完蛋白序列多序列比对后，分析基因家族的保守位点，怎么判断那段保守位点指的哪个氨基酸活性位点呢，然后画出像文献中这样的图

文章 抗独特型抗体制备常见问题解析

...作用。义翘神州可针对这些生物药类型开发PK和免疫原性分析的关键工具试剂，并根据下游的检测需求为客户量身定制抗独特型抗体开发方案。   三、抗独特型多克隆抗体和单克隆抗体该如何选择？ 抗独特型单克隆抗体主要...

问题 基因家族两个结构域

一个有两个结构域的基因家族在分析的时候必须把这两个结构域的对应的蛋白序列分别截取出来吗？还是只要把这两个结构域分别分析之后得到的基因ID取个交集，直接用这个基因ID对应的蛋白质全长序列继续往下分析就可以？

问题 在用gemma分析gwas时，调用perl脚本中的sort_trait.pl，发生报错，请老师帮忙解答，谢谢老师。

perl $scriptdir/sort_trait.pl snp_var.fam \$workdir/05.trait/Thousand_Grain_Weight_2020.txt  |cut -d " " -f 1-5,7 >snp_var.fam1 mv -f snp_var.fam1 snp_var.fam readline() on closed filehandle IN at /home/sdl/trial/5.23gwas/scripts/sort_trait.pl line 11.

问题 老师，为什么pav分析结果是这样，上面显示我的基因编号到99了是为什么啊，没有这么多基因呀，我做出来一个基因组平均才十几个

图太大了放在评论里了

问题 我做顺势作用元件分析时，出现了一下情况，要怎么解决呢？(做的小麦基因组的，我分别下载的每条染色体序列进行提取，是需要修改脚本吗)，谢谢老师

问题 老师，根据您的课程分析拟南芥WRKY基因家族，进化树构建时出现No common sites found for computing distances，该怎样解决？已把大的gap删除

问题 你好，我也遇到了相同的问题“PSMC分析有效群体大小（Ne）,跑出来的psmc.fa文件是空的”，请问你的问题解决了吗？ 我的测序深度是150X

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