...等多种症状。FM由于其病因和发病机制不明，在临床实践中容易被忽视，导致诊断不明，治疗困难。研究旨在调查AKAP12和RNF11是否可以用作诊断FM的生物标志物，并确定它们与免疫浸润的相关性。Lin X, Zhang K, Meng T. AKAP12 and RNF11 as D...
...本 env = na.omit(env) #物种丰度过滤,物种在所有样本中的丰度值要大于样本数(可选过滤) #otu = otu[,colSums(otu) > ncol(otu)] #转置数据：vegan 要求行为样本 otu=t(otu) ``` 数据抽平标准化 vegan包中：rrarefy，按照最小值进行抽平...
根据WGCNA课程中的代码运行Rstudio程序进行分析时，其他的代码都能正常读取并获得相应的图片，但是不能输出GS和MM值表格和cytoscape nodes edges文件。代码输出结果如图所示。请老师帮忙查看，是什么原因，应该如何修改？十分感...
...A序列进行了多序列比对，并将比对的ALN文件粘贴到Boxshade中，但是输出的结果，基因名称不是我原本的名称，且序列比对结果也比较乱，不知道为什么？ 我输入的ALN文件格式如下： ath-miR156g ---CGACAGAAGAGAGUGAGCAC--- mdm-mi...
...s=FALSE,row.names = 1) 文件大概是这个样子的，就是按照课程中的基因表达量提取的方法得到的文件 我知道他的意思好像是第一列有重复的数值，但总共有超过20000行，我不可能一个个排查，想请问各位老师怎么解决。
... 如上图所示，一个文库是有两个哑铃状的测序接头和中间的待测序列构成。 1. Polymerase Read: 是一个测序聚合酶，在一个环装文库分子上，一直读取的序列，一般会很长，可能对环装分子读取了多遍 2. Subreads: Polymerase Read 的序...
R语言中scale函数，可以对数据进行处理，标准化（归一化）在一定的范围，比较适合大范围变化数据归一化处理从而观察数据变化趋势 scale()函数 scale(x, center = TRUE, scale = TRUE) x一般是一个矩阵，也可以是一个数值向量 center--...
...这个文件位置如下 R-v4.2.2/lib64/R/etc/Makeconf 这个目录结构用R的应该都能看懂 这就是文件的样子，画红框的两地方是需要修改的 CC是gcc，cxx是g++，都改成绝对路径就行
...3），是应该把6个测得的reads都相加吗？ ③假如在重复1中，双末端测序（YX-001-1和YX-001-2）得到的reads数不一样，是什么原因？是学生采样的问题吗？
有时我们需要统计文件的某列中某些词出现的次数，可以在Linux下使用sort | uniq -c，那用awk怎么操作呢? 示例文件test.txt a 00 b 01 c 00 d 02 1、统计文件test.txt中第2列不同值出现的次数 awk '{sum[$2]+=1}END{for(i in sum)print i"\t"sum[i]}' test...
...ne_id），现想利用idlist配对关系，批量替换sequece_fasta文件中的gene_id. 请问怎么写perl脚本批量替换， 实现 perl ？？.pl idlist seequnces_fasta.fa output.txt
...如何解决？会影响最后的图吗？我的基因家族间link文件中的基因未完全在最后的图中显示出来 是受到这个的影响吗
...（Chromosome blocks not continuous）： 此时并不知道报错内容中所指的“染色体区段不连续”是什么问题 查看vcf文件前几行： 发现VCF文件似乎排序有问题，于是提取了前几行建索引： zcat filter2.vcf.gz|head -n 100 >filter6.vcf.gz bcftoo...
... ]}EOFsudo systemctl daemon-reloadsudo systemctl restart dockerwindows 中docker设置，之后重启docker：代码如下：{ "registry-mirrors": [ "https://hub.uuuadc.top", "https://docker.anyhub.us.kg", "https://dockerhub.jobcher.com", "https://dockerhub...
...的α-多样性降低，表明噬菌体丰富度较低；Aβ+AD患者肠道中的乳球菌噬菌体的Siphoviridae家族显著减少。使用这些病毒特征构建的预测模型能有效地区分AD和HC患者。 文献链接：https: //doi.org/10.1186/s13195-023-01285-8 Ghorbani, M., Ferrei...