...设置为 -rw-r--r--，这意味着只有文件所有者（在这个例子中是root用户）可以写入或修改这个文件，而所有用户（包括文件所有者、用户组成员和其他用户）都可以读取这个文件。由于没有执行权限，所以不能直接执行这个文件...
...r，输入各物种的蛋白质序列进行分析。 但我分析的物种中，有部分物种在ncbi的基因组下载界面上并未提供protein文件或者注释文件进行下载，或者仅提供了线粒体蛋白质进行下载。 想问下，这种情况下，我是否可以在ncbi的proe...
miRNA测序遇到两个问题： 1.mibase数据库小鼠的前提和成熟miRNA参考基因组怎么找？是直接查找下载里边的吗？搜小鼠的该怎么搜索 2.代码中-k 接头序列，如果是Illumina双端测序样本选择P5还是P7，或者是样本的R1R2分开测
在群基因组选择课程中，模型训练时，出现报错。运行的命令为Rscript $scripts/Bayesian_train.r -g ../01.data_prepare/train_data.csv -t $datadir/train_pheno.csv -tr Trait02 -m BayesC -o BayesC -p BayesC_Trait02；报错为/work/scripts/Bayesian_train.r: error: unrecognized argu...
...的文件系统或者文件系统类型 第4列是挂载选项，通常使用defaults就可以 第5列设置是否使用dump备份，置0为不备份，置1，2为备份，但2的备份重要性比1小 第6列设置是否开机的时候使用fsck检验所挂载的磁盘，置0为不检验，置1...
...件，是目前最主流的snp calling 软件之一。GATK 设计之初是用于分析人类的全外显子和全基因组数据，随着不断发展，现在也可以用于其他的物种，还支持CNV和SV变异信息的检测。在官网上，提供了完整的分析流程，叫做GATK Best Prac...
perl语言中有很多的系统变量，起着重要的作用，例如经常用到的 $_ ， $@ 变量。还有一些不常用到的，例如这里说的 $. 。 $. 代表前一次读的文件句柄的当前行号，在读文件时可以用到。 open (IN,"$in") or die $!;while (<IN>) {c...
前段时间在学习如何使用kvm创建虚拟机，在实践过程中遇到很多不太清楚的问题，靠AI帮我快速解决了这些疑问。 这里以如何修改kvm虚拟机root密码这个问题为例，看下AI的解决效果。 对话如下 ：https://www.doubao.com/thread/w986bf96b9...
...呢？ TLP家族基因鉴定及序列比对 文章作者一共在甜瓜中鉴定了28个TLP家族基因，并统计了相应蛋白的等电点、分子量等信息。同时做了家族基因的多序列比对。 构建物种间系统进化树 作者使用水稻、拟南芥以及甜瓜的TLP...
热图与近缘物种共线性图.pdf 老师们好，我的附件中有打断挂载和未打断挂载的allhic两种热图结果，以及与近缘性物种比对的结果，contigs级别的近缘物种基本呈一条直线，allhic后就出现了问题。我使用的是hifi和hic数据。
...似的功能，共同参与同一代谢过程或存在于同一细胞通路中。 聚类使用的为R中的聚类软件包，所针对的数据为union_for_cluster（差异基因的并集），以基因的相对表达水平值log2(ratios) 进行聚类。其采用相应的距离算法，...
...程被推送到网易首页推荐位，并在网易官方的金云奖评选中荣获平台潜力奖，我们也是唯一入选的生物信息类团队！ 即日起至2022年1月3日，网易云课堂将开展9周年庆活动，我们组学大讲堂也将配合该活动发布三重优惠： 优惠...
...据库的主页，首先需要获取蛋白保守结构域在pfam数据库中的索取号（格式一般为"PF"+阿拉伯数字）。常用的获取方式有两种：第一种是从文献中查找；第二种是从NCBI获取。本文主要展示从NCBI获取蛋白保守结构域在pfam数据库的索...
...通过右上角的控制面板进行基本操作。 （1）在Basic面板中，有Mode options、Label options、Branch options三大板块，Basic面板主要负责修改树的形状、方向，叶标签的字体、字号、位置，还有进化枝的粗细、颜色等基础设置。 Mode：进...
WGCNA的分析要求，其实在WGCNA官网的FAQ中有介绍。我整理一些大家常问的问题，供大家参考： 1. 需要多少个样本？ 1.1 至少需要15个样本，推荐20个以上的样本。 1.2 样本越少，网络的噪音就越大，样本越多，网络就...