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问题 docker在windows系统中安装出错

老师您好！我根据课程以及docker的安装笔记，设置BIOS，开启了虚拟化功能，开启了Hyper-V，但安装docker时报错，而提示中给的链接也一直打不开，想请问一下老师，这种情况怎么解决啊？

问题 MITE转座子

...中比如DNA、LTR所在的行，对应的后面count, masked%的值应该怎么理解？

问题 R包安装

...dmin.html#Installing-packages    请问老师，出现这种情况应该怎么处理？

问题 RepeatModeler注释时显示FastaDB:报错

repeatmodeler显示FastaDB::compact - Error could not locate file/home/Repeat/RM_2358092.ThuMar281748232024/round-4/sampleDB-4.fa!请问老师这是什么原因导致的啊，要怎么解决这个问题。文件路径没问题，第四轮生成的sampleDB-4.fa是空的。

问题 在做系统发育树时遇到了问题

想用拟南芥和自己的数据一起跑系统发育树，结果报错了，是我的基因名字太长了吗，这种情况怎么搞，是要修改基因名吗，如何批量的修改基因名啊

文章 blastn使用教程及结果详解

...nt Search Tool) 是我们常用的短序列比对工具，直接输入fasta格式的序列文件就可进行比对。 ## 下载Blastwget -c ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+/LATEST/ncbi-blast-2.10.0+-x64-linux.tar.gz## 解压tar -xvzf ncbi-blast-2.10.0+-x64-linux.tar.gz 二、bla...

问题 误: 无法分配大小为7.4 Mb的矢量 Killed after 9 m

...，不仅不能解决而且，R软件直接退出去了，请问老师该怎么解决，如果优化代码，该如何优化，希望老师解惑，这个问题一直困扰无法进行下一步。 > # 加载R包 > library(TCGAbiolinks) > library(SummarizedExperiment) 载入需要的程...

问题 eclipse当中R插件StatET安装遇到的问题

老师您好，我在eclipse中安装R插件时，遇到了这个黄色感叹号的提示，请问这个怎么处理啊？谢谢

问题 油棕MADS基因家族生物信息学分析

老师您好，最近读到一篇论文，里面说到：在NCBI数据库检索油棕的基因组数据库，共找到37个被标记为MADS-box基因。请问在NCBI上怎么操作才能有这样的结果呢？谢谢老师

问题 水稻LD的衰减距离如何计算？

这是我用水稻中两个亚群作的图，怎么如此奇怪，如果放在文章中如何描述，这个衰减距离是多少？我看别人文献中关于水稻的衰减距离r²将到一半时定为衰减距离，一般都是100-200kb，而我这个降到一半是0kb是什么情况啊

问题 基因家族成员鉴定

...两个序列明显与其它不同（图中12和25号），请问我应该怎么筛掉呢（写到文章里）？我手动把E-value卡在0.00000001以下时即可把这两个序列去掉了，但是这没法往文章里写啊~

问题 MCSCANX共线性图代码报错

报错如下信息，一般是怎么解决呢？ Exception in thread "main" java.lang.NullPointerExceptionat family_circle_plotter.paint(family_circle_plotter.java:197)at family_circle_plotter.main(family_circle_plotter.java:334)

问题 老师，您好，提取启动子序列时出现错误

我想提取一个已知基因的启动子序列进行分析，已经找出该基因cds的起始位置还有所在染色体，但是运行时出现下面问题，虚拟机内存已经调到最大（26GB），在调大虚拟机就无法运行了，请问老师怎么解决？

问题 泛基因家族分析，核心基因等数量统计

老师，问一下，我统计核心基因、近核心基因、私有基因、可变基因的数量时，是根据存在缺失分析结果统计的，看该基因在几个基因组中存在，但是好像看文献，不是这样统计的，得根据基因相似性，请问具体该怎么操作呢？

问题 get_gene_weizhi.pl 脚本修改

上图为gff文件，请问下边的gene 的位置脚本，该怎么修改？貌似和标准的差别太大了，所以不会修改了。