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问题 在共线性分析中发现结果太少

在共线性分析中发现结果太少，将minspan=30改为=0后结果仍然很少，能不能调整cscore的值呢，这个值指向的是哪个参数啊，是类似于E值的存在吗，怎么调整比较好呢

问题 蛋白组学差异蛋白的筛选

比较两组不同数据时，每组分别设置了四个生物学重复，那么比较这两组数据的差异蛋白时应该怎么把这些生物学重复的数据归一呢？还是要对其中的每一对生物学重复组分别进行比较？

问题 MCScan画图每条染色体不同颜色

求助 我想最后生成每条染色体颜色都不相同的MCScan图，我的layout文件应该怎么设置啊？？？？？ 类似这样

问题 下载docker容器时显示连接超时

这是错误代码： error pulling image configuration: download failed after attempts=6: dial tcp [2a03:2880:f10a:83:face:b00c:0:25de]:443: i/o timeout 请问老师怎么解决

问题 R包在安装BiocManager::install("biostrings")出错

在minconda下,安装R，然后通过BiocManager安装biostrings，出现以下信息，请问怎么解决

文章 Perl 变量命名规则

...殊字符。 变量命名示例 变量名采用 形容词_名词 的格式命名，多个单词之间用下划线分隔，比如 $next_record$total_score$root_node 对于查表的数组或者哈希，采用 xxx_of, xxx_for的命名方式，也就是在末端加上介词，比如。 my %title_of...

问题 Bio-Linux输入命令没反应

 老师您好，我在bio-linux系统里输入调取fa的命令没有任何反应，故意输错文件路径也不会报错。但是输入ll命令反应正常，这是怎么回事啊？

文章 混合线性模型中BLUE值 VS BLUP值 计算育种值与GWAS表型性状数据整合

...首先安装lme4包。install.packages("lme4")多环境无重复BLUP数据格式如下，数据是每个环境叠加的。 有人喜欢用数字表示系名或环境，这样应该把lines和env转换为因子。缺失值用NA表示。lines    env    yL1 env1    66.72533L2 env1    53...

问题 两个结构域的hmm搜索

老师您好，我看了课程里面介绍的都是一个结构域的hmm搜索，想问一下例如HD-ZIP这种具有Homeodomain（HD结构域）和HALZ（LZ结构域）的基因家族怎么做hmm搜索？是两个结构域分别搜索之后合并结果做后续HD-ZIP家族鉴定吗？

问题 关于在DOCKER中分析基因家族的motif

老师您好，我在分析家族motif中出现了这个情况，请问是什么原因呢，我该怎么解决呢，我使用的是DOCKER,非常感谢老师！

问题 质控 Per base sequence content

老师您好，我的测序结果质控的时候发现， FastQC Report 显示结果在Per base sequence content 这一栏大多数呈现下图的样式，我需要cut掉前面几BP吗？如果需要，我应该怎么做呢？

问题 使用FUSION进行TWAS分析权重训练问题

再使用自己的数据进行权重训练的时候，当使用加入blup模型运行GEUV.compute_weights.sh脚本时报错，去除该模型可以正常运行时怎么回事？需要如何解决？

问题 list文件转化为data.frame文件

老师您好，想咨询您一下，我从别人那拷过来的mRNA 资料是list,，list中每一项是一个患者，怎么才能给提取出来整合成为一个dataframe啊？麻烦老师了

问题 具体用那些数据分析 是两两比较还是总的比较

你好 老师 我做了5个时期的种子的转录组，其中有两两比较，具体怎么分析，请老师知道一下

问题 linux系统重启后突然黑屏了！

本来运行都正常的，点了一下系统内的重启按键，突然就黑屏了，怎么调试都调不好（该开的选项都开了，包括虚拟机开关等，该关的也都关了，3D加速也未开），可能是什么原因？/无语