请问查找同源基因家族的时候，E值取多大为宜？或者查找同源基因家族时有什么筛选依据吗？
建立或获取分类器 这种方法要求事先基于参考数据库训练分类器。QIIME 2 团队建议为不同的引物组合建立专门的分类器。对于一些大家常用的引物组合，可直接在仓库中下载（ http://kronos.pharmacology.dal.ca/public_files/taxa_classifiers/qii...
...中位生存期算出来的，但要如何表达你这个cutoff值是如何筛选出来的，我只听懂你说根据最大化延长中位生存期来生成的，但这个专业一点咋说
...法，默认为gsva -k 指定gsva函数中的kcdf参数，使用read count数据时一般设为“Poisson”，使用log后的TPM等数据时一般就用默认值“Gaussian” -p 指定p的阈值 --no_diff GSVA会先将表达矩阵转换成富集分数矩阵，然后再通过差异表达分析...
...029的cor，而红色模块是0.23。我后面要根据GS>0.2和MM》0.8筛选hub gene，然后做后续分析。黑色的模块还能用来分析吗，是不是要舍弃掉。它的cor实在是低，并且P值＞0.05。红色模块是不是还可以继续分析。
抗独特型抗体开发的常见问题解答 一、如何有效筛选出非竞争型抗体？ 首先，在血清效价检测中，使用竞争ELISA的方法对不同动物血清中的免疫反应进行评估，选择竞争抑制率相对低一些的动物进行杂交瘤融合。接下来，在主...
...模式做为未知结构进行匹配的模板，然后用经过对现有的数据库的学习总结出的可以区分正误结构的平均势函数（ Mean Force Field ），做为判别标准来选择出最佳的匹配方式。这种方法的局限性在于它假设蛋白质折叠类型是有限的...
在转录组里筛选的某一个差异基因没有注释通路信息，要如何确定该基因在哪条kegg pathway上？在KEGG在线网页上根据基因ID号也没有查到所在通路。
...的是74个，这个是怎么回事呀，同样水稻也是不同。是E值筛选的时候设置小了吗？具体发文章影响吗？请老师指导。
...st_candidate.gff3有6514个基因，有编码潜力的只有588个，最后筛选的high_quality_gene.gff3只有1538，过滤掉距离太短的只剩下994。您说2500个基因左右即可，但是我预测出来的基因远低于这个数值。有必要在哪一步进行优化吗？
...urv进行分析比较多见。 具体操作如下： # 先看看操作的数据框的结构 > head(exprSet)[0:6, 0:6] bcr_patient_barcode time status NEAT1 MIR205HG LRRC75A_AS1 1 TCGA-2W-A8YY 148 0 37464.39 19.90881 24651.08 2 TCGA-4J-AA1J 226 0 81280.86...
...为YE诱导之后毛状根的酚酸类物质含量测定结果 转录组数据概述及标准分析 测序数据概述：5个样品下机数据经过滤之后分别得到了27M~41M不等的reads（Hiseq 2000，PE100），换算成碱基数量，相当于5.4G~8.2G的clean data。利用Trinity软...
...985年之后以NCI为首的一些研究单位普遍开始放弃体内小鼠筛选，代之为体外的人类各种常见实体瘤肿瘤细胞株筛选。因此，肿瘤细胞作为一种高通量的抗肿瘤筛选体系，成为不可或缺的研究工具，下面我们就一起看看实验室的肿...
ICGC数据库（https://daco.icgc.org/），即国际癌症基因组联盟（International Cancer Genome Consortium），数据库中收集了50种不同癌症类型或不同亚型的肿瘤数据，其中包括基因表达数据，体细胞突变数据（单核苷酸突变和拷贝数变异），以...
1、什么是GEO数据库呢？ GEO数据库全称Gene Expression Omnibus database，是由美国国立生物技术信息中心NCBI创建并维护的基因表达数据库。 它创建于2000年，收录了世界各国研究机构提交的高通量基因表达数据，也就是说只要是目前...