问题 Raw-mode is unavailable courtesy of Hyper-V. (VERR_SUPDRV_NO_RAW_MODE_HYPER_V_ROOT).

...cker desktop，导致toolbox无法启动 Windows10无法完全关闭Hyper-V导致VirtualBox 虚拟机无法启动 Raw-mode is unavailable courtesy of Hyper-V. (VERR_SUPDRV_NO_RAW_MODE_HYPER_V_ROOT). 返回 代码:E_FAIL (0x80004005)组件:ConsoleWrap界面:IConsole {872da645-4a9b-1727-bee2-5585...

文章 ANNOVAR注释变异VCF结果说明

...tics.org/annovar/）（Wang K et al.2010）软件对 SNP 进行注释，其中包括 dbSNP 数据库、千人基因组计划和其他已有的数据库的注释信息，注释内容涵盖变异的位置信息，类型，保守型预测等。 注释之后会得到一个表格文件解释如下，更...

文章 dell R730 清除硬盘数据：

ctrl+R

文章 AI保存PNG/PDF/JPG时“出现了未知错误”的解决办法

...怎么解决呢? 接着往下看↓ 《2》如图：快捷键Shift+Ctrl+S存储为SVG格式，然后点击保存。 《3》保存以后界面就会出现上图保存参数，按照我的选择：文字(SVG)、子集化(无)、图像位置(链接)、包含切片数据(不勾选)，然后点...

问题 treemix用例子，按照步骤操作，得出结果和老师的不同

老师您好，首先感谢您的回复，经您指点，我跟着您课程中的视频，用课程中的例子操作了一遍，并作出了图。 但是发现，我得出的结果和您的不同，热图和似然树都不一样，发生基因流的群体不一样，这是哪里出了问题，还...

问题 老师您好，最近在分析基因家族结构的时候遇到了问题。用视频中get_gene_exon_from_gff.pl脚本提取CDS信息时文件为空（参考基因组gff文件只有CDS信息），之后手动提取基因家族序列信息形成gff文件，用TBtools作图也出现了问题，不知道是什么原因？麻烦老师帮我看看呢？

手动提取gff文件长这样 TBtools长这样 ？？？

问题 SNP分析

...我想问一下您，做群体遗传时，分析SNP 变异率时，可以用zcat clean.vcf.gz|grep -v "#"|wc -l得到总的SNP位点数除以参考基因组的大小来计算么？ 另外对于vcftools --gzvcf all.varFilter.vcf.gz --recode  --recode-INFO-all --stdout --maf 0.05 --max-missing 0.8 -...

问题 您好，请问您paircoil2安装问题解决了吗，我安装也出现了和您类似的问题，我也按照那个文件要求把配置文件放在家目录下，但是仍然命令使用不了，网上实在搜索不到相关信息，只能请问您了，望回复

问题 想请教下，就是我测了种子五个不同发育时期的转录组，想通过转录组数据中的表达量筛选出几个候选内参基因，用什么条件筛选呢？

我是通过所有基因FPKM值得文件进行筛选的，目前知道的是①CV小于0.15，②两个时期比对log2（fold change）绝对值小于0.2，筛选出了四百多个基因，还有什么条件可以筛选呢？比如FPKM值介于多少比较好？

文章 nomogram_multi_cox.r 多因素cox分析构建模型并绘制列线图nomogram

使用说明： 使用方法类似于基因表达量多因素cox分析https://www.omicsclass.com/article/1533 ，但这个脚本支持输入临床数据用于模型构建并绘制列线图，列线图用的R包rms； $Rscript $scriptdir/nomogram_multi_cox.r -husage: /share/nas1/huangls/test/TCGA...

文章 Mapman对表达数据进行venn绘制

...代谢通路注释+基因表达可视化神器--Mapman  按shift 或者ctrl，进行多样品选中，再右键选择venn diagrams，或者在主界面选中venn diagrams，即可进行图片绘制以及阈值设置，之后可根据分析结果，了解venn图每一个区域内注释到的基因...

问题 扩增子测序分析，qiime1的assign_taxonomy.py命令中，如果用blast方法比对序列，可否修改比对的相似度阈值（比如identity或者similarity）？

如题，请教。如何修改assign命令下blast的比对阈值？ qiime1的assign_taxonomy.py命令可以用uclust, blast, sortmerna, rdp等方法比对，同时可以通过修改一些比对的阈值来设置比对的‘门槛’。 但我发现，使用blast方法比对时的阈值，官网...

问题 利用tassel生成曼哈顿图的时候出error

...和基因型vcf也是我自己的文件，分析也能出结果，但是出不了曼哈顿图，麻烦您啦

问题 重测序分析

...个脚本的时候出现这个错误，命令为： # ############合并GVCF方法2 大量样本 ########################## reseq:v2.0镜像支持，GATK 4.4.0.0 # gatk  --java-options "-Xmx20g" GenomicsDBImport  \ #   -L 4 --tmp-dir $tmpdir  -R $REF --batch-size 5  \ #   --reader-thread...

文章 linux命令之cp

...为指定的目录。实例如果把一个文件复制到一个目标文件中，而目标文件已经存在，那么，该目标文件的内容将被破坏。此命令中所有参数既可以是绝对路径名，也可以是相对路径名。通常会用到点.或点点..的形式。例如，下面...