文章 ELISA实验做不好怎么办？QuicKey ELISA试剂盒来帮你！

...或样品各100μL，然后立即在各孔中计入100μL生物素化抗议工作液，37℃孵育90分钟。 2，洗涤3次。 3，加入100μL酶结合物工作液，37℃孵育30分钟，洗涤5次。 4，加入90μL底物溶液。 37℃孵育15分钟左右。 5，加入50μL终止液。 6...

问题 AWK整理泛基因集文件出现部分问题

您好，我在使用以下代码进行格式整理后发现，部分出错 awk -F"\t|-|_" '{print $1$2"\t"$3"_"$4}' 13Pan-genes.list > apple13.pan-genes.list 我的13Pan-genes.list文件如下 整理后的文件如下，有部分基因如Msi开头的没有加上第三列的信息

文章 多分组venn图绘制脚本

...rr)# 读取命令行参数input_file <- args[1]output_prefix <- args[2]# 读取数据文件, 不转换列名venn_dat <- read.delim(input_file, check.names = FALSE)# 从文件中创建一个列表venn_list <- list(venn_dat[, 1], venn_dat[, 2], venn_dat[, 3], venn_dat[, 4], venn_dat[, 5], ...

问题 老师好，想问下将蛋白质序列提交的MEME在线软件后，几天后为什么没有结果啊?显示工作已完成，却没有结果，谢谢

文章 下载TCGA临床信息中的用药信息

... <- "Clinical Supplement" legacy <- FALSE file_type = "xml" # 设置工作目录 setwd(work_dir) # 下载临床数据的结果 DataDirectory <- paste0(work_dir,"/GDC/",gsub("-","_",project)) # 查询可以下载的数据 query <- GDCquery(project = project, data.cate...

文章 敏捷开发实践之Scrum方法运用

...的每个成员需要向Scrum主管回答三个问题:今天完成了哪些工作?明天打算做什么?完成目标是否存在什么障碍?   每日站立例会需要Scrum主管的有效组织。每日站立例会最常见的问题是,团队成员之间陷入了具体技术问题的讨论中,...

文章 在eclipse连接putty的家目录下创建路径连接

...ipse中连接putty，在登录服务器之后，可以在家目录下设置工作路径链接。这样就可以在Eclipse中快速找到所需要的工作文件。如下图的20210908.KEGG.GO文件夹： 设置步骤： 在putty的家目录下，设置$ln -s /share/work/renzx/20210908.KEGG.GO...

问题 泛基因家族分析执行循环时报错

 cat ../id.txt|while read ind;do > hmmsearch --domtblout ./${ind}.2_hmmerOut.txt --cut_tc ./2.hmm ./${ind}.gene.pep.fasta

文章 python 读取kegg绘图配置文件中的kgml文件内容

...l.dom.minidom.parse(sys.argv[1])root = dom.documentElementff=open(sys.argv[2],"w")if root.nodeName=='pathway':    for i in root.childNodes:        if i.nodeType==1:            if i.nodeName=='entry':                link=i.getAttribute('link')                 #print link+'...

文章 Rstuido相关快捷键

...显示文件 Ctrl - 6 显示图像 Ctrl - 7 显示包 Ctrl - 8 显示工作空间

文章 qiime自带的alpha_diversity.py脚本报错

...coverage 在运行时报错 File "/share/work/biosoft/python/Python-v2.7.11/lib/python2.7/site-packages/scikit_bio-0.2.3-py2.7-linux-x86_64.egg/skbio/diversity/alpha/_ace.py", line 70, in ace raise ValueError("The only rare OTUs are singletons, so the ACE " ValueError: The only rare OTUs a...

问题 老师，我想问下您知道有什么软件可以把ped格式转换为fasta（为了使用自己的序列数据），再进行后续的建树工作呢？

我用的PGDspider，转换后是这个样子的，如果设置序列放在一行，又会导致相同ID有两条序列的现象，导致比对不成功，您有什么建议吗？

文章 如何鉴定测序文库是不是链特异性

...测序数据比对到参考基因组上，之后才能进行统计。统计工作可以采用RSeQC软件包中的infer_experiment.py来完成。具体步骤如下：     2.1    采用tophat将原始数据同参考基因组进行比对     2.2    将GTF格式的参考基因注释文...

问题 docker从ENA数据库下载fasq数据时遇到困难

...era-fasp@fasq.sra.ebi.ac.uk:/vol1/fastq/SRR180/069/SRR18033869/SRR18033869_2.fastq.gz ./，运行这个命令后报错。麻烦您能指导一下，谢谢安老师 [root@ddc2073137f4  10:50:56 /work]# ascp -QT -I 300m -P33001 -i ~/.aspera/connect/etc/asperaweb_id_dsa.openssh era-fasp@fasq.sra.ebi....

文章 图片去除大块黑色区域

.../share/work/wangq/script/work/png_black.py -i /share/nas1/fanyc/project/zx-20171030-47_21_ITS/2/ITS_3/4.Analysis_output/Taxa_summary/MEGAN_tree/Taxonomic_treeUsage:  Options:      -i <str>  分类学树状图 png图片所在目录,也是输出目录（目录最后不要带"/"）    程...