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问题 基因结构注释效果不理想

...同源注释，pasa进行转录本注释以后，得到的结果evm.out.gff中的基因数量在20000个左右，但是相关文章中已经有30000+的基因注释了，那怎么去提升注释的结果啦。

问题 泛基因家族分析-SV和表达量

老师，我要绘制这个图。现在我不知道SV类型，我看demo中06文件的All.final.sv明确指出了SV，而我的文件是这样的

问题 如何挑选所需的顺式作用元件？

老师好，我的实验是跟饥饿相关，通过分析已经得到了靶标基因的顺式作用元件，但是我如何从这么多元件中，挑选哪些是跟我处理相关的元件。

问题 基因家族分析 scaffold 基因可以删除吗

基因家族分析后，90个基因中有一个定位在scaffold上，这个基因可以删除吗？不删除的话后续染色体定位和共线性分析作图不好看

问题 重测序cnv变异需要至少多少乘数据？

老师我看到您再重测序课程中说CNV变异至少需要30乘数据，请问这个有文献说明吗？能不能分享一下

文章 Rocks集群系统(cluster)的安装与管理维护

...护 1.添加节点 如果要向cluster添加节点，在主节点上使用 insert-ethers 然后在子节点设定网络启动。实现自动化安装。 2.添加用户 用一般的添加用户的命令进行操作。 adduser username passwd username rocks sync users 特别最后一行命令...

问题 如何提取biotype_classs.txt

老师，您好，您能再详细介绍一下如何从ensemble 上的基因注释文件中提取biotype_classs.txt 这个文件码？谢谢

文章 在线绘制差异基因kegg注释图

...，能够帮助大家了解差异基因分属于哪些代谢通路，文章中如果能够插入下面这类图来说明样品间的差异，一定会为你的文章增色不少。 下面给大家介绍一下如何在Windows下对差异基因进行kegg注释。 一、输入数据准备： 首...

问题 mapman Mercator注释碱基序列过长如何解决？

mapman Mercator注释碱基序列过长，fasta文件中“N”过多如何解决？ 损失数据太多，无法继续。道友前辈们有什么解决办法么？

问题 想要bsa分析和绘图的脚本

两个亲本两个子代，我想自己从vcf文件开始分析，之前报了那个49.9的bsa课程，但主要是从docker中操作，我想用R进行分析，我想咨询怎么才能得到那个脚本，很喜欢做出来的那个图。。。。

文章 corrplot包绘制相关性图，简单又好看！

...大的工具，能够帮助我们量化变量间的关联程度。R 语言中可以做相关性矩阵可视化的包有很多，小编最喜欢用的还是corrplot 这个包。 corrplot包非常容易使用，并在可视化方法、图形布局、颜色、图例、文本标签等方面提供了丰...

问题 基因组组装相关问题

老师您好，在基因组组装中有一些问题想问一下。在使用ont数据和hifi数据进行基因组组装时，使用的fastq.gz文件是经过质控后的吗，如果是使用质控后的数据的话请问咱们组学大讲堂有没有讲解这部分内容的资料。

问题 共线性分析

我想做基因共线性分析，课程示例中的生成文件，我的数据库不全，我想要自己补全， 这是示例文件，我想问一下第二行gene_symbol:LON3 description:Lon protease homolog 3,mitochondrial [Source:UniprotKB/Swiss-Prot;Acc:Q9M9L8 ] 是必须有么？因为我这...

问题 MEGA建树闪退

老师您好，我在使用MEGA软件构建进化树的过程中，使用NJ法，泊松模型，bootstrap 1000次，但总是还没建完就闪退了，这是MEGA11的情况，然后我换了MEGA7来重新尝试建树，但是这样就会出现这样的情况： 而且构建的进化树也不能完...

问题 差异基因表达分析

...ad.   是否是正确的  以及输出文件仅有4个 与课程视频中的预期不同  所得到的文件没有样本名称  请问老师 这是哪里的问题吶