话题 RNAseq的docker分析中获取基因全长报错

问题 基于全基因组信息进行AAI和ANI分析

老师们好。我想做一下基于基因组来计算DNA-DNA hybridization （DDH), Average Nucleotide Identity （ANI), Average Amino Acid Identity （AAI）分析，但是要使用的俩个软件（Jspecies和CompareM）不太会弄，有没有哪位老师做过，谢谢！Q：1870871361

文章 GWAS分析哪个模型最优

GWAS关联分析课程推荐：https://bdtcd.xetslk.com/s/2KgXQq 前面我们介绍了GWAS分析中很多不同的模型GLM，MLM, CMLM,ECMLM,  MLMM，SUPER，FarmCPU等详情见：《GWAS分析模型介绍》。那么我们在做GWAS分析的时候选择哪种模型分析更好呢？下面介...

文章 肾病最新研究进展：通过生物标志物检测进行早期预测和干预

...。 文中的主人公才27岁，是一名年轻的程序员，他结婚不久，本该前途无限，对生活抱着无限的憧憬和希望，但是因为一次体检，就把这些美好全部打碎，主人公患上了二级高血压和慢性肾病一期。 这位年轻人的遭遇不是个例...

问题 求助，MCscanX分析基因家族绘制圆圈图时报错

报错情况：

问题 TCGA生存分析cut off

COX教程里通过ROC曲线确定最佳cut off，这个cut-off值大于1 也是正确的么，文章中怎么解释？

问题 用虚拟机做基因组共线性分析出现这样子是什么原因？

用虚拟机做基因组共线性分析出现这样子，提取的cds和bed文件中除了染色体还有scaffold

问题 从NCBI下载了转录组数据，文件类型为文件，这类数据能不能分析

老师，您好，从NCBI下载了转录组数据，文件类型为文件，这类数据能不能分析？

问题 单细胞测序数据KEGG富集分析执行代码后报错

...mp;执行此代码报错，且已经参考RNAseq有参转录组数据自主分析分析中的方法，--ann.db org.Ss.eg.db 和--organism ssc均按照要求进行修改，依然报错，想知道问题出在哪里？怎么解决？谢谢老师

问题 转录组自主分析课程中遇见的问题

老师，我在学习转录组分析的过程中遇见了一些问题。 转录组自主分析的课程中，在学习的过程中，感觉很辛苦。基因表达定量生成的矩阵文件gene_read_counts_table_all_final.tsv中的基因的ID是这种：ENSG00000063515和MSTRG.1。到了基因功...

问题 OTU分析报错

老师您好！我遇到了和其他同学一样的问题，也都看了您对大家的回复，检查了自己的内存和数据库路径满足要求，还是会报错，同时无法生成”otu_table.biom“文件，用的是与您一致的示范数据，请问是否有别的解决办法，谢谢...

问题 泛基因组分析，磁盘配额不足

老师您好，解压基因组文件过程中，解压一半解压不了了，显示磁盘配额不足怎么办，我现在基因组有22个茶树品种，每个又比较大。

问题 想请问安捷伦双通道芯片数据得到了cy5和cy3通道的数据，想要做一些其它的分析，请问可以单独提取cy5的数据吗？然后对cy5中的数据重新进行别的分析？比如细胞类型反卷积之类的

我想要分析cy5通道样本的变化，能否只单单提取出cy5通道的样本呢？表达矩阵是通过exp=exprs.MA(averMAList)这个操作得到的

问题 有参转录组分析过程存在组装过程吗？

有参转录组到底有没有组装出转录本？存在组装过程吗？

问题 基因家族分析-基因组内共线性

请问为什么我的结果中染色体出现了 这种情况