找到约 15 条结果

文章 linux 文件权限详解及修改

...机制。其中swaps 为交换空间的使用情况,tty 保存tty设备信息,version Linux内核版本和gcc版本。我们可以发现,这些与系统紧密关联的文件全部为只读,即使对于root用户。   图1 /proc下的部分文件    2 . 文件权限的划分 Linux...

文章 选购生物信息分析用笔记本电脑应该考虑的因素

很多同学会有这个疑问:做生物信息分析对笔记本电脑要求高吗?我的笔记本够用吗? 贵的笔记本性能就一定强吗? 我发现目前网上这方面的信息很少,甚至还有些生信大V做错误的高中低配笔记本推荐,点进去一看“中配”...

文章 外显子测序发现遗传性NK/T细胞淋巴瘤癌与FAM160A1基因突变相关

...由于肿瘤的转移在确诊6年后死亡。患者患病治疗的详细信息见下表: 家系图分析 由于家庭中同时有两兄弟患有NKTL肿瘤,是极其罕见的,作者推断为遗传性肿瘤。绘制家系遗传图,通过家系图分析可以判断,父母不患病...

文章 用Ai助手帮我写脚本

...文件格式去准备文件。比如,染色体中基因涉及正负链的信息,如果不能一次性消化AI给的回答,可以分布提出需求,理解了之后再对脚本进行加工处理。最终得到如下的回答,回答分为4部分:1输入文件格式 2perl脚本编写内容 3...

问题 16S FastMap文件如何填写能否像详细讲解一下,视频中说tap1文件就是ckd就是肾病患者的简称填写吗,我搜到的是tap列通常用于记录与每个样品关联的分类工具或方法的信息。像这样,能否详细说明一下

SampleID Barcode Primer Group tap Description S1 BC1 F341 Control RDP Classifier using Silva 132 database Soil sample from forest S2 BC2 F515/R806 Experiment QIIME 2 with Greengenes 13_8 database Water sample ...

文章 GEO和TCGA数据挖掘生物信息文章解读(宫颈癌)

...表达网络 利用R语言中的WGCNA包,根据差异基因的表达量信息构建共表达网络,作者获得了4个共表达模块,其中蓝色模块与宫颈癌正相关,棕色模块与宫颈癌负相关(下图c),因此作者在这两个模块中挑选hub 基因用于后续分析...

文章 鉴定domain同时分析蛋白互作

...(见下图A),而提交之后跳转页面显示出对应的结构域信息,同时还展示了互作关系Interactions。其蛋白互作信息是基于STRING数据库获取,通过输入蛋白,能够判断哪些基因编码的蛋白与该蛋白存在紧密联系。譬如:以人的ANLN基...

问题 基因组gff文件

gff文件里没有5' 3'UTR信息,能继续做分析吗,没有UTR信息比如做出来的基因结构图只有CDS序列

文章 在家学习基因家族分析技能!-在线直播,2020年11月12日开班!

​基因家族分析,既是一个可以快速掌握的生物信息分析技能,也是低成本SCI文章思路。基因家族文章写作模式相似,换个物种或者基因家族就又是一篇文章,可借鉴性很强,且发文数量依然不减,是低成本短、平、快SCI文章的...

文章 从gff文件当中提取对应转录本ID的基因结构信息用于GSDS绘制结构图脚本更新

脚本名称:get_gene_exon_from_gff.pl 用法:perl ../script/get_gene_exon_from_gff.pl -in1 WRKY_domain_new_out_emoved_redundant.txt -in2 Arabidopsis_thaliana.TAIR10.31.gff3 -out gene_exon_info.gff 输出结果(部分): 脚本源代码: use Getopt::Long; my %opts; use Data::Dumpe...

文章 什么是MD5

...生出一个128位(16字节)的散列值(hash value),用于确保信息传输完整一致。MD5由美国密码学家罗纳德·李维斯特(Ronald Linn Rivest)设计,于1992年公开,用以取代MD4算法。 应用: 一致性验证 MD5的典型应用是对一段信息(Messag...

文章 phytozome植物基因组下载网站

...据基因相关功能结构域批量下载相关基因的CDS,PEP等序列信息; 基因组下载 该网站需要注册登陆之后才能下载基因组数据:注册也非常简单,这里就不详细说明了:注册完账号登陆就可以:https://phytozome.jgi.doe.gov 登陆之后...

文章 Linux查看IP地址

...终端中输入以下命令: ifconfig 你将看到网络接口的详细信息,包括IP地址。 2.ip命令: ip 命令是一个更现代、更强大的工具,用于管理网络接口。要查看IP地址,输入以下命令: ip addr 这将列出所有网络接口的详细信息,包...

问题 老师,请问一下为什么提取基因在染色体上的位置时,查看gene_chr.txt是空的,位置信息没有被提取出来呢?我看我的gff3文件中,gene后面对应的并不是我提取出来的基因的id,图中画出来的。请问是这个原因吗?要怎么解决?

问题 老师,您好,我的物种没有基因的染色体位置信息,用get_gene_weizhi.pl脚本提取的只是一些片段,不是染色体,然后script/tiquxulie.pl脚本运行后,得到的就是一列短曲线。请问老师我这个能画基因的顺式作用元件图吗,有什么其他方法没有,谢谢老师!