hic数据和rnaseq数据是否可以进行snpcalling并进行群体分析,需不需要额外的什么处理
在筛选GWAS关联区域内的基因时,基因或者SNP与选定的显著关联区域有百分之多少的交集可以定义为关联区域内的基因或者SNP
老师,我想问一下您,做群体遗传时,分析SNP 变异率时,可以用zcat clean.vcf.gz|grep -v "#"|wc -l得到总的SNP位点数除以参考基因组的大小来计算么? 另外对于vcftools --gzvcf all.varFilter.vcf.gz --recode --recode-INFO-all --stdout --maf 0.05 --max-miss...
Ka/Ks分析是生物信息学中最常见的分析之一,它在研究核酸分子进化方面有重要应用,如果你还不知道的话——咳咳!注意听讲了! 01 “什么是Ka/Ks?” 在遗传学中,Ka/Ks表示的是两个蛋白编码基因的非同义替换率(Ka)和同...
请教老师,mcscanX能否用于动物基因组内基因家族的共线性分析?我看教程中是用于植物
我按介绍的方法操作,几种添加序列的方法都尝试了,一直显示NO MATCH。看方法和序列都没问题,把序列单独提出来,可以查找。这是什么原因呢?谢谢哈