问题 你好老师，我想请问一下，有没有代码可以计算群体的多态性信息含量PIC值，观察等位基因数A，有效等位基因数Ae啊，ddRAD测序做的分析有限，想增加点分析

比如文献里计算的这些

问题 circos基因加倍分析最后一步报错

用circos进行基因加倍分析时，最后一步，提示如下错误。 用的config文件是培训课上config2,txt文件，chr.info截图如下： 请问哪里出问题了呢？ 这是我的图的一部分 这是别人发表文章当中的图。

问题 基因注释后进行β多样性分析时报错

老师，在运行基因注释后做beta多样性分析时，在eggnog的路径以及script路径下运行均出现了这种报错信息，请问该如何解决？

文章 共线性分析绘图报错

下面是所有共线性分析画图的步骤，重新画了好几次都是错误的，数据也都从新输入了好几回。就一开始的获取基因对应的蛋白序列信息是从文件互传上传服务器的，所有生成文件核对了少了个后缀是tandem的文件，请问是哪里出...

文章 miRNA合成以及miRNA命名

...加工为miRNA前体precursor miRNA（pre-miRNA），pre-miRNA在exportin-5的介导下运输到胞浆，在细胞质中进一步由dicer酶加工为成熟的miRNA。 miRNA的5p和3p      有的miRNA前体两个臂分别产生一条有功能的成熟miRNA，他们分别靶向不同的位点...

问题 重测序分析docker

想问一下服务器上已经有docker了，还需要下载组学大课堂那个reseq的那个docker嘛

问题 遗传图谱分析课程

在QTL定位这部分，如何实现多个环境下的多个性状在同一张图中展示QTL定位结果，视频里只介绍了每个性状单独进行QTL定位。

问题 泛基因家族分析-SV和表达量

老师好。请问最后绘制的柱形图是根据with_SV和without_SV的平均值绘制的吗？我的结果就只有这个基因ID，然后分析显示无显著性差异，我也想绘制一个图。程序画的图太大了，所以我想自己画一个，。

文章 空间转录组细胞共定位分析结果解读 MISTy分析

细胞共定位分析（cellular co-localization analysis）是空间生物学研究中的一个关键工具，它通过检测不同细胞类型或分子标记物在组织切片中的空间分布模式，揭示细胞间的邻近关系和潜在的相互作用。这种分析方法能够帮助我们理...

问题 单细胞测序细胞通讯分析

进行猪样本的单细胞测序数据进行细胞通讯分析时，cellphonedb method statistical_analysis meta.tsv normalize.data.tsv \   --counts-data hgnc_symbol   --iterations=100 --threads=1，这个代码里面 --counts-data hgnc_symbol 中的"hgnc_symbol"需要修改吗？改为什么...

问题 生存分析：老师,我看到了这个生存分析的代码在利用索引定义一个新的向量时先定义了一个,想请教一下您他为什么刚开始要定义一个纯0向量呢,先谢谢您啦

问题 老师，请问在fst和pi联合选择分析的时候，使用群体遗传进化分析课程里的代码fst_pi_select_sweep.r时，显示command not found，怎么解决这个问题呢？

问题 老师好，我在进行染色体定位时，有两个基因显示不能定位到染色体上，这个需要怎么解释？我在后面顺势作用原件一系列的分析中，还需要分析这两个基因吗？麻烦老师解答，谢谢老师。

文章 考研“网红”们：直播考研复习，是真学习？还是博眼球？

...有各种各样“花式备考”新操作出现： 有为了省时间“不洗头”的： 有上演各种“花式占座”的： 有在朋友圈转发锦鲤的： 还有怒删游戏的： 归根结底，这些花式操作都是为了能专心备考、一击即中！ 大家...

问题 TCGA基因表达怎样和临床信息结合做生存分析

我已经整理好两个表，一个是样本和基因的表达量的，另一个是样本和生存时间，生存状态的。请问怎样才能把两者结合起来做生存分析？有相关的代码吗？