...章中的利用hmm文件也就是对应基因家族的隐马尔科夫模型筛选得到一个蛋白序列,另外我又采取blast的方式将我要研究的这个物种和其他几个物种的该基因家族序列信息进行比对,获得另一个蛋白序列文件,现在想将二者进行合...
请问老师这该怎么解决
目前已经知道了p值显著的位点信息(几号染色体及位置),下一步该如何做呢?是要去参考基因组的gff文件中找到snp位点附近是否有基因吗,获得基因编号后要去什么文件中进行检索,不知道文章中曼哈顿图上标注的基因都是...
视频课程已经学完,有一个问题,视频中演示的搜索拟南芥的NB-ARC基因家族,这里的拟南芥属的蛋白质序列,是有很多不同种的拟南芥的吗? 我自己在实际操作的过程中是不是需要把我研究的物种的属下面所有的不同的种的蛋...
转录组筛选差异表达基因时的Log2FC和FDR值是什么意思?可以自己调吗?
利用VIP>1;p<0.05筛选出的差异代谢物数量太多了,能不能吧VIP的阈值提高至1.3或者1.5呢?
...anscript一列的内容?? demo步骤如下: #去除重复的hmmer搜索的转录本ID,多个转录本ID保留一个作为基因的代表,此步建议对脚本输出的文件手动筛选,挑选ID: perl script/select_redundant_mRNA.pl mRNA2geneID.txt WRKY_domain_new_out_selected.txt...
...和5000个基因。 第二步、分别对这3组基因集进行GO富集,筛选出层级大于7,P值小于0.5的富集基因,分别包含700(10000个),1200(18000个),176(5000个) 第三步,将700,1200,176分别进行蛋白互作,用mcode找到得分最高的子网络,进...
...查行与col顺序和行顺序。 4.通常情况下,颜色会被自动分配给段。您可以通过包含一个包含RGB颜色的行(和/或列)来分配颜色到段。 如果一个列和一行共享一个标签(例如A),那么两个颜色定义(在颜色行和列中)必须是...
...,并且预计未来几年还会很火。 拥有CRISPR-Cas9文库筛选服务文库筛选服务,基因编辑So Easy! 虽然CRISPR/Cas9系统相对其它基因编辑工具更简单,但是,操作起来也并没有那么的容易,你需要构建各种载体以及包慢病毒等...