问题 我的基因组文件很奇怪，转录本不是正常的加个“.1”“.2” 我就全部都去掉了只剩下基因ID，在提取蛋白序列的时候怎么将将本 get_fa_by_id修改一下才能提出来呢

问题 用circos进行基因组共线性分析。config1.txt 用的是老师给的参考资料中的文件。最后运行绘图命令时出现如下报错，请问老师这个是哪里出问题了呀？要怎么解决呢？谢谢老师~

问题 老师我想问一下用circos绘制基因组内共线性图时，config2.txt文件中的目标基因link.txt部分怎么更改才能使目标基因在图上的字体放大并且设置斜体？如下图：

问题 老师，您好，我下载下geo原始数据，经标准化处理后，基因的表达值显示为 964316794613767；9 这是什么意思，不是说过表达值经log处理基本上在0-几十的样子，怎么变成这样了？这两个数字代表什么意义？

问题 老师，您好，微生物多样性分析课程里质控数据统计分汇总中的$scriptdir/qc_stat.qc脚本是样本名称吗，下载了公众号的文件，没找到scripts文件，这一步不知道怎么运行了

问题 我是应该选择出现多个结构域的文件吗，重复是指第十八和十九条染色体上同一个位置相同结果出现两次，那我该怎么判断哪个才是我的基因家族的保守结构域呢

问题 请问大佬，做转录组分析时，fpkm_and_plot.R分析数据时，出现错误Error: Aesthetics must be either length 1 or the same as the data (100276): x，这个怎么解决呀？

问题 在提取1500bp序列做顺式作用元件检测时，使用tiquxulie.pl这个脚本，开始时显示out of memory，我把虚拟内存提高到了4G，显示zsh：killed,得到的结果还是空的，请问老师这个问题怎么解决呢？

谢谢老师。

文章 SNP分析中由于基因组序列过长导致报错解决方法

...学习链接：WGCNA-加权基因共表达网络分析 4. 转录组数据怎么挖掘？学习链接：转录组标准分析后的数据挖掘 5. 微生物16S/ITS/18S分析原理及结果解读 6. 更多学习内容：linux、perl、R语言画图，更多免费课程请点击以下链接： htt...

问题 我根据课程算出了单条染色体某一段区间的FST和pi值，但是画图的时候有问题了，怎么画出单条染色体某一段区间的FST和PI图

课程里的画图脚本是根据所有染色体的索引文件画的，我想根据计算出来的FST和pi值，画出单条染色体某一段区间的图，请老师指导一下

问题 mapman导入自己的转录组数据，从网站上下载了数据分析时用的参考物种的mapping数据，但使用时显示data does not fit mapping used(no data points mapped)! 请问该怎么解决？谢谢

问题 您好！我分析的基因家族因为没有PFAM号，我用blast比对了。也上传到了NCBI 进行了Batch CD-Search 得到了hitdata.txt,但是我下一步该怎么做啊？如果去构建HMM模型啊？

问题 老师，我在做不同物种共线性分析的时候，配置文件的过程中出现如下错误，刚开始是按照视频教学的复制文件过来用，后来报了这个错，就从头配置白菜基因组文件，但是还是报一样的错，想问问怎么解决？

问题 TCGA数据生存时间怎么确定？

我从TCGA下载了临床数据，但是怎么得到生存时间，用哪个数据？ [1] "bcr_patient_barcode"                         "additional_studies"                           [3] "tissue_source_site"                          "patient_id"        ...

问题 感谢老师的回答，但我的虚拟机不是这个问题，而是虚拟机“ Bio-Linux-8.0.7”在启动期间意外退出，退出代码为1（0x1），请问老师这个问题应该怎么解决呢?另外我的系统是win8.1