问题 不同物种的基因家族共线性分析的图片

请问老师下面图片中，不同物种的基因家族共线性分析的图片怎么做？这个家族基因数目少，希望老师解答，谢谢！

问题 老师好，基因家族聚类结果怎么统计每个物种这两种情况的基因数量啊，multi_ortholog:该家族在所有物种均存在，且至少在1个物种中的成员数大于等于2个；other_ortholog:该家族在至少两个物种中存在，且至少在一个物种不存在；

问题 请教！基因结构分析出现这样的问题如何解决？

基因结构分析使用“perl ../script/get_gene_exon_from_gff.pl -in1 WRKY_domain_new_out_removed_redundant.txt -in2 ../Arabidopsis_thaliana.TAIR10.41.gff3 -out gene_exon_info.gff”跑不出结果，之后手动筛选出来，却没有exon等，用GSDS也没有结构，请问这个是不是无...

问题 检查数据是否正确

代码： multiExpr=read.csv("5000.csv",header=T,comment.char = "",check.names=F)datTraits=read.csv("Trait1.csv",row.names=1,header=T,comment.char = "",check.names=F)allowWGCNAThreads()ALLOW_WGCNA_THREADS=4memory.limit(size = 20000)# 检查数据是否正确：exprSize = checkSets(multiExpr)# 统...

问题 请教TCGA差异表达分析分组问题

能咨询一下TCGA做差异表达分析的问题吗？课程视频是根据barcode分为肿瘤和正常两组，我想自己分组，按照II期肿瘤的预后分为死亡和生存两组，想问一下应该怎么分？

问题 基因家族分析，保留蛋白编码基因的脚本

老师好，在进行基因家族分析时，运行保留蛋白编码基因的脚本，运行过程正常，没有报错，但最后得到的文件却是空的，请问这是什么原因呢？如何解决呢？

问题 泛基因家族分析-互作图

老师，我运行下方程序报错，信息如图所示，这是为啥？ #差异表达家族基因与转录因子的共表达分析和作图 Rscript ../scripts/ppi_network.r TF_fpkm.xls WRKY_deg_fpkm.xls meta.2.txt WRKY 0.01 0.9

问题 老师，微生物多样性分析课程资料中没有找到scripts文件，微生物多样性分析中的质控数据统计除了用$scriptdir下的文件还可以用其他的吗？

问题 老师，在pca分析作图中需要分组文件，如果我的群体没有分组文件，那么应该如何确定分组，是先用structure分析确定最佳分组后再做其他的pca和进化树吗？

问题 基因家族分析

等电点

问题 基因家族分析

这里的segmental和tandem是大片段复制和串联重复吗

问题 泛基因家族分析

老师您好，如何将gbff文件转换为gff文件

问题 泛基因家族分析

如何获取泛基因组的基因表达量数据（fpkm）

话题 方差分析

话题 全基因组关联分析