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问题 使用xpclr分析出现TypeError: ufunc 'true_divide' not supported for the input types'

...所规定不能使用虚拟机）。在使用课程提供的黄瓜重测序数据进行xpclr分析的时候出现了这样的报错： 2022-06-24 16:17:24 : INFO : running xpclr v1.1.2 2022-06-24 16:17:24 : INFO : Loading VCF /public/home/weijiehong/miniconda3/lib/python3.7/site-packages/allel/...

文章 蛋白质比对结果快速分类taxid

nr数据库在分类的时候有一个文件,即accession2taxid用来把accession number分类到taxid 但是由于和这个文件极大,直接比对速度相当慢,就写了以下两个脚本 #include <stdio.h> #include <stdlib.h> #include <string.h> #include <unistd.h> #i...

文章 OrthoFinder 输出结果文件说明

...无根物种树、有根物种树，基因重复事件以及相关的统计数据。 1. Orthogroups 文件夹 Orthogroups.tsv、Orthogroups.txt：记录了 MCL 中 成功聚类（直系同源组中基因数 >= 2）的每个 Orthogroup 所包含的基因。 Orthogroups_UnassignedGenes.tsv：...

文章 遗传进化英文方法参考

...threshold was set as 1/n (n, total SNP number).     基因组重测序数据分析视频课程：https://study.163.com/course/introduction/1210221805.htm?share=1&shareId=1030291076或者扫码二维码：     Reference [1] Li H, Durbin R. Fast and accurate short read alignment with Bu...

文章 R 语言赋值运算符区别：`

...正如上文所说，如果不是有人会这么无聊在R 语言里进行数据分析时用 <-弄个这么坑爹的函数参数，这个赋值号的意义本身是很清晰的。<- 长得像箭头，实质上也是个箭头，如果觉得从右向左赋值让你觉得不爽的话，用 -&g...

问题 Blast2go本地化过程中，运行官方文件b2g4pipe_v2.5.zip中“runPipeExample.sh“报错“The host did not accept the connection within timeout of 60000 ms;”

....shenwei.me/local-blast2go-installation/”对blast2go本地化过程中，数据库已经完整导入，然而运行官方软件“sh runPipeExample.sh”时报错“The host did not accept the connection within timeout of 60000 ms;”，请问如何解决，希望详细点。 Prepare data for GoS...

文章 影响GWAS关联分析好坏的因素

...lot 考虑群体结构以改善GWAS定位结果。五条竖虚线是模拟数据中预设的causative 位点，每个位点能解释最高10%的表型变异。a、一般线性模型结果；b、混合线性模型结果。前者假阳性较多，后者效果要好一些，但是同样存在一个假...

文章 UbuntuLinux系统环境变量配置

...用、biolinux搭建生物信息分析环境、linux命令处理生物大数据、

文章 敏捷开发实践之Scrum方法运用

...开发团队还需要把能展现产品功能效果的图、表、日志等数据提前保存下来,以防突发情况导致现场展示失败时无内容可展示。在会议开始时,Scrum主管和开发团队需要确保所有人员对产品和该冲刺的目标有所了解,如果有人对此不...

文章 腾讯敏捷之道，实施敏捷开发,看我就够了

...响应市场变化和客户需求，同时还具备成熟的立体化智能数据分析系统，可自动生成报表，帮助企业科学量化团队表现，实时把控项目进展。CORNERSTONE适用于各行各业，产品体验链接（https://www.cornerstone365.cn/）。

文章 linux生物信息软件安装管理工具conda使用

...用、biolinux搭建生物信息分析环境、linux命令处理生物大数据、perl入门到精通、perl语言高级、R语言画图、R语言快速入门与提高、python语言入门到精通

文章 Bowtie2使用方法与参数详细介绍

...bowtie2-build用法bowtie2-build默认情况下将fasta文件换成index的数据库。bowtie2-build <fasta文件> <要生成的索引文件前缀名> 必须参数：-x <bt2-idx>由bowtie2-build所生成的索引文件的前缀。首先 在当前目录搜寻，然后在环境变...

文章 BSA分析中QTL-seq 分析：95% 99%阈值置信区间是如何计算的

...pend=F,row.name=F)    }                     模拟好的数据：simulation_result.zip

文章 天天加班,为什么团队研发效能还是那么低?

...目分布、进度计划、质量风险等，并从中获取客观的实时数据，帮助管理人员分析、评估项目，全面了解组合内项目状况，以便作出及时决策。 2.4 项目监控 项目监控，是保证项目进度，保证项目可以在规定时间内保质...

文章 qiime2 vsearch OTU 以及 ASV流程整理

...data demux-joined.qza \ --o-visualization demux-joined.qzv #质控过滤数据 qiime quality-filter q-score \ --i-demux demux-joined.qza \ --o-filtered-sequences demux-joined-filtered.qza \ --o-filter-stats demux-joined-filter-stats.qza qiime metadata tabulate --m-input-file demux-joined-...