问题 利用人类基因组进行群体遗传PSMC分析求助

老师好，我买了群体遗传的课程想用人的基因组进行PSMC分析，我的bam文件是按照染色体分的，一共22个常染色体22个bam文件，那么他们如何作为输入文件写进代码里面呢？我看代码输入文件是一个bam文件，我是需要把bam文件进行 ...

问题 cytoscape软件中cytohubba计算问题

你好，冒昧打扰你啦。我看到你好像也遇到过cytohubba得到的结果每次都不一样的情况，不知道你后来解决了吗，想来请教你一下

问题 寻找合适做分析的基因家族

老师您好，我看了这个文章，鉴定了9个物种，后面的生理实验只用了葡萄一种，我可以选择其他八个物种中的一个再进行鉴定和后续的实验吗

问题 老师 我在做共线性分析时配置文件怎么准备啊，share里边空的

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问题 psmc分析群体历史的时候，参考基因组ref.fa要怎么获取

psmc分析群体历史的时候，参考基因组ref.fa要怎么获取？

话题 RNAseq的docker分析中获取基因全长报错

问题 基于全基因组信息进行AAI和ANI分析

老师们好。我想做一下基于基因组来计算DNA-DNA hybridization （DDH), Average Nucleotide Identity （ANI), Average Amino Acid Identity （AAI）分析，但是要使用的俩个软件（Jspecies和CompareM）不太会弄，有没有哪位老师做过，谢谢！Q：1870871361

文章 GWAS分析哪个模型最优

GWAS关联分析课程推荐：https://bdtcd.xetslk.com/s/2KgXQq 前面我们介绍了GWAS分析中很多不同的模型GLM，MLM, CMLM,ECMLM,  MLMM，SUPER，FarmCPU等详情见：《GWAS分析模型介绍》。那么我们在做GWAS分析的时候选择哪种模型分析更好呢？下面介...

问题 求助，MCscanX分析基因家族绘制圆圈图时报错

报错情况：

问题 TCGA生存分析cut off

COX教程里通过ROC曲线确定最佳cut off，这个cut-off值大于1 也是正确的么，文章中怎么解释？

问题 用虚拟机做基因组共线性分析出现这样子是什么原因？

用虚拟机做基因组共线性分析出现这样子，提取的cds和bed文件中除了染色体还有scaffold

问题 从NCBI下载了转录组数据，文件类型为文件，这类数据能不能分析

老师，您好，从NCBI下载了转录组数据，文件类型为文件，这类数据能不能分析？

问题 单细胞测序数据KEGG富集分析执行代码后报错

...mp;执行此代码报错，且已经参考RNAseq有参转录组数据自主分析分析中的方法，--ann.db org.Ss.eg.db 和--organism ssc均按照要求进行修改，依然报错，想知道问题出在哪里？怎么解决？谢谢老师

问题 转录组自主分析课程中遇见的问题

老师，我在学习转录组分析的过程中遇见了一些问题。 转录组自主分析的课程中，在学习的过程中，感觉很辛苦。基因表达定量生成的矩阵文件gene_read_counts_table_all_final.tsv中的基因的ID是这种：ENSG00000063515和MSTRG.1。到了基因功...

问题 OTU分析报错

老师您好！我遇到了和其他同学一样的问题，也都看了您对大家的回复，检查了自己的内存和数据库路径满足要求，还是会报错，同时无法生成”otu_table.biom“文件，用的是与您一致的示范数据，请问是否有别的解决办法，谢谢...