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问题 老师好,我想请问一下在绘制基因家族 exon–intron structure 时如果参考基因组GFF文件里没有exon和UTR信息,只有mRNA和CDS的话怎么办呢?

问题 老师您好!我在用samtools获取染色体长度时报错,可能原因时Contig1中的序列长度不一致,这种具体该怎么处理呀?我看了它的序列是图上这种样子的

问题 在进行WGCNA时,为什么会有如下报错,要怎么解决呢?:Error in hclust(dist(datExpr0), method = "average") : N must be at least 2.

问题 老师您好,我想请问一下您,我的电脑Hyper-V启用不了,勾选了之后下载完了显示无法完成请求的更改,显示错误代码:0x80071A91,您知道怎么处理吗​

问题 老师您好,在分析IBD的时候出现Exception in thread "main" java.lang.IllegalArgumentException: missing genotype separator (.),这样的报错,VCF已经过滤,设置的是0.8,这是怎么回事

问题 在T2T基因组直播课程中第八步根据参考基因组挂载染色体,共线性图出来后在这怎么操作得到最后的基因组染色体版本?

问题 请问老师,泛基因家族的数量是根据什么定的啊,如果说几个基因组共有的加上单个基因组独有的话,怎么还会有的基因不存在任何一个基因组呢?

问题 老师您好!我是组学大讲堂基因家族分析课程的学生,请问现在omicsclass的镜像是不能拉取了吗,里面的gene-family镜像是不是删除了,怎么找不到了。

问题 老师您好,我在进行megahit组装后运行quast.py这段出现报错,查看megahit.log文件后,出现的最后一行command的信息为Exit code -15,请问这是怎么回事呢?

问题 我用gemma做小麦的gwas分析,到最后一步生成曼哈顿图时出错,是因为参考基因组的染色体编号与基因型数据对应不上吗,应该怎么老师解答

文章 如何计算蛋白序列的长度、分子量、等电点等信息

...学习链接:WGCNA-加权基因共表达网络分析 4. 转录组数据怎么挖掘?学习链接:转录组标准分析后的数据挖掘 5. 微生物16S/ITS/18S分析原理及结果解读 6. 更多学习内容:linux、perl、R语言画图,更多免费课程请点击以下链接: htt...

问题 老师,麻烦您看一下我下载了这种series_matrix.txt 文件后续可以怎么分析,找到我自己一些感兴趣基因的表达量绘制热图,看这个文件像是双通道芯片对吗

GSE10487_series_matrix.txt.gz

文章 如何快速获取多条序列长度信息

...里还是分享一个虚拟机的bio-linux的工具,samtools。命令行格式:samtools faidx   xulie.fa(你的序列文件)结果会生成一个 xulie.fa.fai文件,也是就是在你的序列文件名后面多了一个fai,文件合适如下: 211000022280750 9865 142631474 60 61211...

文章 Beta多样性分析

...样本间不存在多样性差异,数值越接近1,表示样本间的β多样性差异越大。PCA分析 主成分分析PCA(Principal component analysis)是一种研究数据相似性或差异性的可视化方法,采取降维的思想,PCA 可以找到距离矩阵中最主要的坐标...

文章 GEO在线分析工具--GEO2R进行基因差异表达分析

...获得分析结果。 以下内容,将利用案例数据GSE106876 (B细胞淋巴瘤9个样本数据)进行演示。   GEO2R分析页面 通过GEO主页Tools,点击Analyze a Study with GEO2R,可进入GEO2R分析页面(网址:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/geo2r/),页面显示...