老师,您好,请问是否有真核无参转录组的分析流程,网课里面只有有参转录组分析教程,或者贵公司是否有计划发布无参转录组实操网课
老师好,在进行基因家族鉴定分析时,提取基因家族成员的位置信息后发现,发现有些基因的基因名称不同,但其位置信息完全相同(比如下图中的3个不同基因的在基因组中的位置信息完全相同),请问这种现象正常吗?还是...
这个是三个提交之后的结果 下图是我的gff文件 下图是我试着把ID后面的部分信息删掉之后的gff文件 这样之后还是出不来结果。求指教
...年,我国女性乳腺癌发病数将达23.4万例,比2008年上升31.15%,数据触目惊心。 据报道,全球每100个新确诊的乳癌病例中,有12个来自中国,新发病率增长速度是世界平均水平的2倍,平均发病年龄比西方国家早10-15年。 5年生存...
进行PCA分析报错没有输出文件
在无参转录组分析中,通过Blast2go 比对得到了go和kegg注释信息,也通过Deseq2得到了差异基因,那么请问如何实现GO和KEGG的富集分析呢?在看clusterprofiler进行富集分析的时候需要两个数据,一个是gene id ,另一个是org.***.eg.db注释文...
就是基因家族分析,去除基因转录本重复这里,应该出来的是基因和对应ID号,我这里出现的是蛋白号XP
老师,我做拟南芥和苜蓿之间我的基因的协同性分析,拟南芥中有3个,苜蓿中有七个,协同性分析结果只有一条基因配上了, 水稻里面也是三个,一个都没配上,请问正常吗?
请问,在TCGA差异分析课程中的差异表达矩阵是用ensembleID表示lncrna,而TCGA生存分析的表达矩阵是用lncrna的gene symbol,请问是怎么转换的,用ensemble官网转换之后,代码总报错,请问该怎么解决呢,谢谢
2个组织部分,在不同处理下,具有4次生物学重复的组学分析。 利用什么分析方法,可以在一张图中得到:不同处理,这两部分组织的之间的关系(聚类)
没有参考基因组的话,做基于转录组的基因家族分析的时候,步骤和有参考基因组的有什么区别呢,学习正常的基因家族分析可以吗,或者是否有单独的课程教学呢
1.分析时,是否可以去掉不好的基因(如缺失、无功能注释的)? 2.分析时,是否需要补充某些基因的功能注释,以及它们对应的KEGG通路? 3.多组韦恩比对时,差异基因少或共有基因太少,怎么才能保证其富集通路的准确性? ...