使用命令 blastall -i Homo_sapiens.pep.fa -d query_pep.fasta -p blastp -e 1e-5 -b 1 -v 1 -m 8 -o human.out 提示WARNING: ENST00000501597: Could not calculate ungapped Karlin-Altschul parameters due to an invalid query sequence or its translation. Please verify the query sequence(s) and/or fi...
我是通过所有基因FPKM值得文件进行筛选的，目前知道的是①CV小于0.15，②两个时期比对log2（fold change）绝对值小于0.2，筛选出了四百多个基因，还有什么条件可以筛选呢？比如FPKM值介于多少比较好？
...通过显微镜观察，来确认银杏胚珠花粉室形成过程中的各个阶段，从而确认取样时间点为花粉室形成前和形成后两个时间点，各3个生物学重复，共6个样品用于转录组测序分析。 为了评估样品的生物学重复的可靠性，作者做了PC...
... 3、 根据OUT在各样本的丰度计算其相关性，发现了11个可能与甲烷循环相关的OUT模块（如下图A，每个圆圈代表1个OUT，不同颜色代表不同的OUT模块，皮尔逊相关性系数大于0.6的OUT则用线相连，线越短相关性越强）。 4、 ...
...胞的来龙去脉吧。 实验研究中的肿瘤细胞 为了在体外更好地研究肿瘤，自人类第一次成功从名为Hela的癌症患者身上分离出Hela细胞，并在体外培养成功过后，这66年以来已被广泛应用于肿瘤研究，成为医学研究中十分重要的工...
...量测序，并用现在十分火热的机器学习的方法成功找到5个OTU可作为CKD的诊断标志物，可区分患者与对照AUC值达到0.9887。下面来解释一下作者是如何设计实验和分析的：实验设计：作者在郑州和杭州两地收集健康和CKD患者的粪便...
这样的试验设计是否可以回答120个品种，样本太少的问题。
...家是不是还是很疑惑？下面我们就借助一张图来帮助大家更好的理解GSEA的分析原理。 GSEA分析原理： 第一步 基因排序： 如上图左边的热图所示，GSEA分析的第一步就是利用所有基因的表达数据，然后计算每个基因在两...
tgsgapcloser --thread 15 --min_nread 3 --min_match 2000 --scaff ../genome.final.fa --reads ../ont.fasta --output ONTReads --racon /share/work/biosoft/Racon/latest/build/bin/racon 占用了800个G的运行内存，内存不够，自动退出了，怎么设置参数控制内存吗