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文章 dcaps标记设计软件——SNP_Primer_Pipeline

...TCCACCACAAACAATTATACGCTGCTTACAAAAATTAACGGGAGAGGAAATTACTGCCTTGGTGCTG 输出结果: index   product_size    type    start   end     diff_number     3'differall     length  Tm      GCcontent       any 3'       end_stability   hairpin primer_seq      ReverseComplement    ...

文章 使用DNA序列做主成分分析(PCA)——R语言adegenet包

...构造一个分组信息,然后用散点图加置信椭圆的方式展示结果 df.pca.scores$population<-ifelse(df.pca.scores$PC1>0,"pop1",                                 ifelse(df.pca.scores$PC2>1,"pop2","pop3")) 若使用自己的数据,则输入准确的分组信...

文章 高学历真的贬值了吗?中科大博士写外挂、海龟硕士造假车票.....

...本身没有将心思放在正路上,急于求成,所以才有这样的结果, 虽然现在研究生压力大,但是,如果你没有知识、没有学历而还想获取高薪职业的话,真的是太难太难了。 总之,高学历依然是如今社会获取高薪的绝佳“捷径...

文章 singularity使用基础

...用即可。在需要使用容器的时候,用户可以先在云平台上搜索是否已经有制作好的镜像,如果没有,再考虑自行制作容器镜像。 Singularity 支持很多云平台,用户可以在云平台上搜索,并下载所需镜像 Sylabs Cloud singularity pull ubun...

文章 cytoscape软件的安装与使用_v3.10.2

...者直接点击最左侧“App Store”也一样。 2. 在插件面板中搜索自己想要下载的插件,输入关键字然后回车,进入网页版Cytoscape App Store。 3. 红框框起来的是安装软件时默认下载好的插件和已经下载好的插件。 4. 进入网页版Cytosc...

文章 剑桥女大学生跳机自杀:学术研究遇到瓶颈到底怎么解决?

...棘手的事情时,同时去做一些更简单、更有可能得出积极结果的事情, 比如一个小小的实验、或者一次小长跑等等。 即使是微小的成功,也能让你在漫漫几个月毫无进展的过程中都鼓舞到自己的士气,让自己感觉有所收获。 ...

文章 BSA分析算法中的ED算法和SNP-index有什么区别?

...ED值。为降低单个SNP位点计算带来的偏差,需要对得到的结果进行拟合。阈值的选择使用分位数方法,即对所有的拟合值从小到大排序,选择大于99%(常用)的SNP标记ED值作为筛选时的阈值,每个性状阈值可以不同。ED法具有很强...

文章 科学分析:国自然的评委都是哪些人?

...国自然基本上快落下帷幕了, 剩下的时间就是等待复审结果了,不管怎么,可以稍微放松一丢丢了。 说到这里,你可能和学霸姐姐有一样的疑问,那就是—— 我们的国自然本子可能会送到谁手上? 对啊,让我们“坐立不安”...

文章 ssGSEA.r 单样本基因集富集分析

... B cells IGHA1 B cells TNFRSF17 B cells ABCB4 B cells BLNK 结果说明: 得到每一个样本的不同基因集中的NES值:  NES值:用最大值与最小值间的绝对差对ssGSEA分数进行标准化。 cell_type TCGA-B7-A5TK-01A-12R-A36D-31 TCGA-BR-7959-01A-11R-234...

文章 gff文件格式不标准的修改脚本

...Parent属性值生成修改后的行,并输出;    3.将处理后的结果写入输出文件。 这个脚本的重难点和知识点如下: 正则表达式的使用:这个脚本使用了多个正则表达式来匹配和替换不同的模式。正则表达式是一个非常强大的工...

文章 SCI文章绘图及数据统计暑期班

...生的基本技能。数据在统计分析之后,最重要的就是要把结果可视化的展示出来,而R语言也有非常强大的绘图功能,很多高水平杂志当中漂亮的图都是应用R语言绘制的. R 言培训 R语言这么强大,大家都很想学习。但是R语言...

文章 单细胞转录组数据挖掘流程记录-非小細胞肺癌(NSCLC)(GSE127465)

...ry \ --vars.to.regress nUMI percent_mito --high.variable.genes 2000 结果展示: 单细胞转录组分析课程推荐:https://bdtcd.xetslk.com/s/4i88K6

文章 Treemix 软件:群体基因交流分析的得力工具

...构。 .covse.gz: 协方差矩阵的标准误差(standard errors)。 结果绘图 1.树图 2.残差图 参考资料: 软件下载:https://bitbucket.org/nygcresearch/treemix/downloads/ https://yanzhongsino.github.io/2022/03/20/bioinfo_geneflow_TreeMix/ https://www.jianshu.com/p/92...

问题 电脑内存不能升级,运行Rstudio内存一直上升,请问还有其他方法解决这个问题吗。

... have been already downloaded > # 整理数据,FileNameData为R保存结果,方便下次再次提取数据 > prepare.met <- GDCprepare(query = query.met, +                       save = TRUE,  +                       save.filename = FileNameData, +      ...

文章 简述一代、二代、三代测序技术在应用上的区别

...早利用数据,完成成果转化,才是最大的经费节约!看懂结果,分析数据少不了生物信息学的帮助。组学大讲堂(专业生信培训机构,学员突破1.5万人,18年金云奖唯一获奖生信团队)精心制作了29门生物信息视频教程,涵盖转...