问题 perl $scriptdir/vcf2hmp.pl all_clean.vcf.gz hapmap.txt.gz始终显示找不到脚本，但脚本在我设置的路径中，不知道该怎么解决

文章 TCGA 数据进行lncRNA, Gene 的WGCNA 联合分析

        我们在《TCGA-基因差异表达分析》课程中讲解了对lncRNA, Gene和miRNA 分别进行差异表达分析。一般会得到非常多的显著性差异表达的分子（lncRNA, Gene, miRNA）, 差异表达分子太多，还是无从下手，需要从中再进一步的筛选...

问题 泛基因家族分析分析 pav中统计样本数量

问题 如果这个群体可以做生态适应性分析，那还适合做GWAS分析吗？群体结构的结果到底是怎样的才说明这个群体适合做GWAS分析?

怎样的群体结构分析结果更适合做GWAS？

问题 基因家族分析之基因结构分析

利用你们的脚本，demo文件，genefamily镜像，运行get_gene_exon_from_gff.pl脚本没有报错，但是结果文件是空的，奇怪了，请老师回答下，谢谢！

文章 TCGA中转录因子的调控分析

...境变化等多个方面。今天介绍一个针对转录因子进行生存分析的网站：CistromeCancer   1. 转录因子调控基因的预测和相关性分析 2. 生存分析：输入非常的简单，选择不同转录因子和不同的癌症即可，生存分析的曲线就显示出...

问题 基因家族分析Mcscan分析时，无法提取蛋白序列。

基因家族分析Mcscan分析时，无法利用AT.gff文件提取蛋白序列，做的水稻，此外，我怀疑只有一个转录本时，在gene DI后加-00，多于1个转录本时从-01开始编号，在拟南芥中，按照您的教程，只能提取到多于1个转一个录本的蛋白序列...

问题 老师，我现在肠道菌群送检的数据有两个批次，用的引物序列不一样，在去除引物的操作中是分为两组去除吗，还是在一起去除两次，去除后如何合并两组处理后的数据

问题 做基因家族分析上游顺作用原件分析时，启动子序列提取结果现显示如下

 做基因家族分析上游顺作用原件分析时，启动子序列提取结果现显示如下，请问是哪出错了

问题 无参转录组怎么分析？

老师，我购买了有参转录组分析课程，现在需要分析无参的，请问是不是无参的分析流程就是不用基因组比对这一步，直接进行转录组组装。按照有参课程就可以分析，还是说分析流程还有别的区别？ 谢谢

问题 关于基因家族共线性分析：MCScanX和circos都可以做共线性分析，有区别吗

《基因家族分析 19年版》课程中关于基因家族共线性分析： 1、MCScanX和circos都可以做共线性分析，有区别吗？2、课时17：这两个文件是怎么得到的？

问题 请问老师有根据基因ID一次性提取UTR,EXON,INTRON的脚本吗？

组学大讲堂基因家族分析课程里给的脚本貌似只能提取EXON和INTRON，请问能给一个把UTR也提取出来的脚本吗？谢谢！ 编程太菜，一时半会儿琢磨不出来 T_T||| 我试了组学大讲堂之前提供的一个脚本貌似不行,.....https://www.omicsclass...

问题 泛基因家族分析，Ka/Ks分析

老师，我之前按照课程做泛基因家族分析中Ka/Ks分析，得到了密度分布图上，只显示107个基因（除去832个私有基因外，还有118个基因），然后我查看all_kaks文件，有很多的NA值，另外，还有一些值非常大，比如GRAS41  2128.0700 GRAS9 ...

文章 windows 中的docker如何设置容器的内存与计算资源 hyper-V

...电脑都不能胜任（内存限制），只能做练习使用。如果要分析数据尽量选择内存多的台式机或者服务器。 组学大讲堂云服务器即买即用，避免安装软件的麻烦和内存限制： https://study.omicsclass.com/ 

问题 MCscanX绘制共线性圈图的染色体信息文件family.ctl和基因家族信息文件如何获取？

老师，您好！我正在学习基因家族分析课程，利用MCscanX绘制共线性圈图 已经获得gff文件，collinearity文件 请问染色体信息文件family.ctl和基因家族信息文件gene_family.txt如何获取？ 您说过gene_family.txt是”基因家族信息文件，写为...