...支持: 包括人、小鼠、大鼠、斑马鱼等多个模式生物。多数据源聚合: 聚合了来自NCBI、Ensembl、UniProt等多个主流数据库的数据。灵活的查询: 支持多种类型的基因标识符。批量操作: 支持批量获取和注释，提高工作效率。多语言支...
...间的流逝，他会让你的家目录越来越臃肿，因为他的缓存数据.vscode-server默认存放在你的家目录， 但是该拓展内置了解决办法首先如上图红线所示进入设置，在搜索框键入以下标签 Remote.SSH: Server Install Path 随后设置自己的item...
...?persistentId=doi:10.17617/3.AEOJBL）中未找到该List，向原作者要数据会有些困难，请问这个List是否重要的事泛基因编号，我是否可以通过别的方法从而进行泛基因组家族分析的PAV分析，谢谢老师
...该组资料必须服从正态分布；若是配对样本T检验，每对数据的差值必须服从正态分布；若是独立样本T检验，个体之前相互独立，两组资料均取自正态分布的总体，并满足方差齐性。之所以需要这些前提条件，是因为必须在这样...
...明RNA速率可以用于推断细胞发育轨迹。那么单细胞转录组数据中是否可以检测到剪切的mRNA和未剪切的m RNA呢，作者分析了常见的单细胞 RNA测序方法均依赖于oligo-dT 引物来富集聚腺苷酸化 mRNA 方法，发现基于 SMART-seq2、inDrop 和 10x ...
...##############################################> # 1. 下载TCGA甲基化数据> ############################################################> # 查询需要下载的甲基化数据（本次分析只下载肿瘤样本）> query.met <- GDCquery(project = tcga_project, + ...
...，得到的举证C(i,j)是第i列与第j列相关系数。 例如如下数据： log2Ratio_miR log2Ratio_Gene-1.43072567351625 1.37874741391777-1.43072567351625 1.11756970634256-1.43072567351625 1.67994238012443-1.43072567351625 3.05079253633835-1.43072567...
...验结果和背景区分，排除非特异性的效应，获得高质量的数据。 所以单一阳性对照已经很难满足其实验要求，只有对照设置的越充分，得到的实验结果才会越精准。 首先，我们需要了解非特异性信号产生的原因： 比如常见...
...在mapman软件中的pathway中没有该如何？ 2、在添加自己的数据时，所有样本差异基因表达量作为一个文件上传，还是每个样本差异基因表达量单独上传？如果添加的是比较组，是比较组所有基因id？还是比较组注释上的id？或比较...
我想请问一下能使用mummer进行无hic数据的辅助挂载吗，如果能，能分享一下流程吗？
老师您好，我在用emmax做gwas的时候，前期的数据都处理好了，最后到用emmax进行关联分析的时候.ps文件显示只有23条染色体（其实有26条+2条性染色体），但是.e文件也没有报错.o文件也显示成功完成，前边map文件也显示28个染色体...
在您TCGA-基因差异表达分析课程中，数据下载中提取Gene表达量矩阵时您用到了perl脚本，但是视频里您没有将如何在自己的电脑里运行。我双击您写的perl脚本，或者用cmd命令行，都运行失败。恳请您百忙之中予以解答，万分感谢~
上次提到了提供的docker的images中没有找到repeatmasker的数据库RepeatMaskerLib.h5的问题。紧接着我发现流程中的famdb.py脚本也找不到，这个脚本我再课程提供的脚本文件夹中中没找到，同时我在docker的镜像中也没找到。是不是和RepeatMask...
您好，我按照流程处理自己的数据，在ALLHiC_partition -b sample.clean.bam -r draft.asm.fasta -e DpnII -k 15这一步，因为测序的物种是15条染色体，但运行后只有1个group出现：sample.clean.counts_GATC.15g1.txt，没有出现预期的15个group,请问是什么问...
学习过程中报错，用老师的代码和数据，前面出图和老师的一样，卡在这步 sft = pickSoftThreshold(datExpr0, powerVector = powers, verbose = 5) pickSoftThreshold: will use block size 2938. pickSoftThreshold: calculating connectivity for given powers... ..working o...