问题 老师您好，我用orthofinder2跑出来的多序列比对文件总是空的，导致后面分析报错，这个该怎么解决呢老师。

问题 老师，我在预测启动子顺式作用元件时，出现out of memory,是怎么回事，下面是我报错的截图

这是我报错的截图 这是输入文件的截图

问题 老师您好，在您的课程《基因组重测序数据分析实操课程》中：变异结果注释ANNOVAR，在运行table_annovar.pl 如何解决报错：Died at /data/home/sft/pkg/annovar/coding_change.pl line 677

老师您好：下面是命令行和输入文件格式 命令行及具体报错信息： 输入文件格式：

文章 MCScanX 安装报错，支持64位系统

...容 最前面添加 #include <unistd.h> 正确的做法是用vi打开文件，分别在三个文件（ msa.h, dissect_multiple_alignment.h, and detect_collinear_tandem_arrays.h）的最前面添加： 而不是文件名开头，下面做法是错误的： 如果还报错，...

问题 请问老师，泛基因家族鉴定开始做自己的物种时，怎么在docker 里上传自己需要做的物种的数据

用这个指令进入docker work里面 data一直是教学时玉米的数据 曾经尝试过在FZ里pangene里的data上传自己的数据

文章 如何批量分析蛋白序列domain-SMART数据库

...数提交进行分析即可（参数可以选择仅输出分析结果文本格式）。 譬如小编把拟南芥的一部分蛋白序列提交之后结果如下图，移动滚动条可以对所有分析结果进行浏览。 推荐课程： 基因家族分析实操课程、基因家族文献...

问题 treemix指定root的问题

老师你好，听完课程以后，有一点我不是很明白。treemix软件说明书是要指定root的，但是我是一个种的群体，没有放其他外群信息，在不知道群体关系的情况下，是不是可以不用指定root进行基因流分析呢

问题 利用MeV绘制基因热图时出现问题

.../article/263里介绍的方法利用MeV进行基因热图的绘制，已将格式转化为文本文档的分隔符制图，上传时候并没有默认第一列为基因ID，不显示紫色背景，显示There is no spot data available，请问这个问题怎样解决？

问题 tassel 画进化树报错

#文件格式转换运行完代码后run_pipeline.pl -Xmx40G  -SortGenotypeFilePlugin -inputFile ../00.filter/clean.vcf.gz  \    -outputFile clean.sorted.vcf.gz -fileType VCF  run_pipeline.pl  -Xmx40G -importGuess  clean.sorted.vcf.gz  \    -ExportPlugin -saveAs supergene.phy -format Phyli...

问题 我的转录组数据与参考基因组比对后发现基因间区及内含子比例较高，是怎么回事？

我的转录组数据分析发现基因间区及内含子比例超过了30%，是不是很高，一般是多少？是什么原因造成这两类比例高？

问题 老师，请问在STRING数据库中没有丹参，怎么把互作网络中的拟南芥名称改成丹参的呢？

由于STRING数据库中没有丹参，所以搜索的时候选择了拟南芥。

问题 合并选择区域时出现错误，请教一下，要怎么解决呢？是不是把前面的- 删掉

[root@c2d1f4f23ca0  09:47:04 /work/3.map/vcf]# sed '1d' *.selected.region.txt | bedtools merge -i - >fst_top0.5_selected_region.txt Error: Sorted input specified, but the file - has the following out of order record hic_scaffold_13100014100002.170817908590890.004903580.00525442 -0.099696108570...

问题 老师好，我在做进化树的时候报错

我按照视频一步步做的，到了构建进化树那一步，突然出现如下问题我在论坛上找了好像大家都没有出现过类似问题，老师我这个是我的蛋白序列格式错了吗

问题 老师你好，我购买了“微生物OTU网络图绘制(Cytoscape)”，在sparcc这部分时一直报错，请问我该怎么解决

问题 网络分析中在MENA中做出环境因子和OTU之间的联系之后，怎么在Cytoscape中可视化呢？谢谢老师

就是这些步骤完成之后如何可视化，https://www.omicsclass.com/article/558