问题 进化树中基因分类的问题

老师，您好！ 我近期构建了一只进化树，但是分类方面感觉面临一些问题；不知道如何分类好，树的体量比较庞大。有没有相关的软件呢？ 附上树的附件： testtree1_wag.nwk

问题 PPI网络蛋白如何转化回mRNA?

请问，以多个mRNA在STRING网站进行PPI分析，并将图导入Cytoscape软件制图后，各个结点是变成了蛋白质的名称了吗？如何转化回mRNA名称呢？谢谢！

问题 PPI网络蛋白如何转化回mRNA?

请问，以多个mRNA在STRING网站进行PPI分析，并将图导入Cytoscape软件制图后，各个结点是变成了蛋白质的名称了吗？如何转化回mRNA名称呢？谢谢！

问题 老师您好！物种里面只能在ncbi找到全基因组数据，只有fna和gbff文件，缺乏数据应该怎么解决呢？

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/assembly/GCA_007927625.1

问题 生成MCScanX的gff文件时发现蛋白序列id是cds序列的id，请问怎么转成mRNA或者geneID

问题 TCGA数据下载完成后，运行prepare代码进行数据整理时，Rstudio总是白屏死机，怎么办？是电脑配制不够吗？

问题 您好，我想问下使用CMplot包绘制曼哈度图，怎么能让某个感兴趣的染色体变宽，其他不变

问题 老师，您好，恳请帮助，请问VPA方差分解分析中交叉部分为负值，并且可解释部分＋不可解释部分不为1，这个怎么解释呢

问题 老师您好，我在导入虚拟电脑时出现错误，返回代码：E_INVALIDARG(0x80070057),请问这个怎么解决，谢谢老师

问题 有关群体pop_Group.txt的问题，最大可以分几个组，如果分组太多怎么修改脚本的颜色设置

问题 有老师会解决这个问题嘛，新手怎么也不会解决，从gtf文件中提取splice sites错误，报xa0错误

问题 麻烦各位大神，请问我的oython执行文件找不到了（我自己都不知道是哪个了）怎么处理啊？求解答，谢谢各位

问题 NCBI上下载的CDS序列的ID和GFF文件的ID对不上，导致CDS提取失败怎么办

问题 卸载重装后docker后为啥docker pull omicsclass/organelle-assembly:v1.0怎么下载不了这个镜像了

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