...的对照样品比较计算后可以获得DNA的倍性关系。 2. 测序数据分析 Smudgeplot： 从k-mer数据库中提取杂合k-mer对，然后训练这些杂合k-mer对。通过比较k-mer对覆盖度的总数CovA+CovB和相对覆盖度CovB/(CovA + CovB)统计杂合k-mers对的数量，解...
您好，我看了您发布的《pacbio 三代全长转录组数据分析流程 Iso-Seq 3》的文章，另外我在github 上也看了isoseq3的流程，发现您的文章中没有isoseq3 refine 这个步骤。不过虽然github上有这个步骤，但是isoseq3 中并没有refine 这个工具（...
例如这样的数据 GSVIVG01025691001 GSVIVG01026145001 GSVIVG01014236001 GSVIVG01021397001
基因组重测序数据分析视频课程： https://study.163.com/course/introduction/1210221805.htm?share=1&shareId=1030291076 或者扫码二维码： 可以使用tassel GWAS分析软件 转换： perl /share/work/biosoft/tassel/tasseladmin-tassel-v5/run_pipeline.pl -Xms64G -Xmx64G...
...sembly文件，我看教程里似乎要组装后genome.fa文件进行与hic数据的比对，但是verkko的组装结果文件里似乎没有这个文件？
我做的核桃，数据是按无参基因组分析的，以拟南芥为参考基因组。现在核桃的基因组也已经公布了。请问，我应该怎么分析我的miRNA的启动子呢？
我用的RNA-seq的数据，并且也用hisat2建立索引了 但是比对的时候总是报错
老师，请问用自己的数据，前面处理都没有问题，运行filter部分前还是'data.frame': 15 obs. of 24897 variables，运行给的filter部分代码后，总是显示0 variables，请问该怎么解决呢？谢谢
R语言在读取数据 例如read.table 添加check.names=F 参数可以保证数据种特殊的字符正常读取： 如数据表头 “-”被认为是“." > A=read.table("F:/test/WGCNA/data/fpkm/All.DEG_final_3000.xls",sep="\t",check.names=T,header=T)> head(A,2) ID ...
第一套数量比这套大多了，都能正常跑，这一次数据量一般，不知道为什么一直卡着不动。
...道该转录因子是不是对癌症的生存率有影响 如果您对TCGA数据挖掘感兴趣，请学习我的TCGA系列课程： 《TCGA-生存分析》《TCGA-基因差异表达分析》《TCGA-转录因子调控》《TCGA-ceRNA调控网络分析》
...用引号引起来："Stage IA" --fdr 0.05 --fc 2 设置差异基因的筛选条件：显著性和差异倍数（默认fdr=0.05，fold change=2） 使用举例： $$Rscript DEG_limma.R -e TCGA-ESCA_gene_expression_Counts.tsv \ > --fdr 0.05 --fc 2 -m metadata.group.tsv -t subtype.hclust ...
随着数据分析在科研工作中重要性的逐步提升，越来越多的老师、同学投入到生物信息学习的浪潮中来。 可生物信息学是门综合学科，很多生物出身的人在计算机软件使用、统计学等方面基础十分薄弱，方法上也经常找不对...
这个临床数据下载挺全的，但是胃癌相关的：病例报告，slide，还有msi怎么下载? https://www.omicsclass.com/article/1125
老师好：我的是双端测序的下机数据，每个样本三个重复，每个重复两个reads，是没有将两个reads拼接合并导致的吗？