问题 lefse分析细节

当进行多组间lefse分析时，每组得到的lda score分数高的，是不是就是这组比其余组显著高的微生物物种，这样会不会忽略掉这组显著低于其余组的微生物物种?

问题 你好，老师。同一个基因用视频流程获取的启动子序列2kp，是mRNA前面的2kp，不是CDS区前的2kb.现在提取的启动子都是CDS区前的2kb啊，mRNA与CDS区的注释长度不同，就导致我们获得启动子区域不正确

问题 染色体挂载问题

请问在染色体挂载时如果不知道染色体条数应该怎么办，核型做不出来

问题 无参物种可以进行基因家族分析吗？

无参物种可以进行基因家族分析吗？

问题 请问老师有没有"医学癌症TCGA-基因差异表达分析"课程基因表达数据下载后提取癌症组织数据，并用于课程“医学癌症TCGA-生存分析”的代码，感觉跨度有点大。

问题 TCGA 鲁棒性分析报错

按照TCGA 生存分析课程做 鲁棒检验老是报错 rust_test.zip

问题 mapman处理后的数据分析和总结

...      我用我的FPKM均值在MAPMAN上画图。如下     要如何分析每个途径有哪些上调，哪些下调，哪些先上调后下调，哪些先下调后上调？每个去看吗？会不会太主观了？有那么多个途径。求指教，或者能不能分享下经典的用MAPMAN...

文章 实时定量PCR技术原理及标记方法详解

...测每次PCR循环后产物总量的一种方法，是核酸检测和定量分析的“金标准”。   技术原理   实时荧光定量PCR根据所使用的荧光标记方法可分为两种：荧光染料（SYBR Green I染料为主）和荧光探针（TaqMan探针）。   ①SYBR Green I...

文章 农艺性状表型数据与环境关联互作分析R代码

...,file="05.表型与基因型环境年度互作效应.csv") 第二版版本，注意PCA分析升级，输入数据行为样本，列为表型；local({r <- getOption("repos")  r["CRAN"] <- "http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/"   options(repos=r)}) options(BioC_mirror="https://...

问题 基因家族分析数据准备

基因家族数据准备中，运行到保留蛋白编码基因这一步时运行完检查文件protein_coding.gff3，发现有些基因好像后面不是gene_biotype，这对后面的分析有影响吗？还是需要改一下代码

文章 请教kaks分析

请教下各位老师，关于kaks分析的问题。我有50株菌，想看某个基因在这50株菌中是否正向选择。50株菌意味着有50条这个基因的序列，两两比较后就很多kaks的结果，有大于1也有小于1的，那我该如何判断这个基因是否在50株菌中被...

问题 请问如果我先对蓖麻，拟南芥等的CDPK基因家族做了blast分析，找出了蓖麻中的CDPK基因，还用进行那些hmmer分析什么的吗

问题 我的分析内容是16s分析肠道菌群，我是按照咱们课程里的步骤进行的，但是source env.sh 这个命令输入后出现这个界面，请问如何解决

问题 请问如何结合转录组数据分析某基因家族的表达量

我有几个不同浓度胁迫下的转录组数据，想利用此数据分析一下某基因家族，请问如何结合转录组数据分析某基因家族的表达量？

文章 2023年秋季线下/直播培训火热报名中！

...员处理数据的能力不足之间的矛盾。所以，谁会生物信息分析，谁能处理基因数据谁就是课题组最亮的仔！ 在这个天高气爽的秋天组学大讲堂为大家准备了丰富多样的培训课程，早报名可享受早鸟价优惠！购买录播课的学员参...