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问题 关于转录组发表sci

我们课题组测了基因组但是还未曾发表,但同时让公司以基因组的测序结果为参照测了有参转录组,那现在手机的这个转录组数据能不能发sci???跪求翻牌~~

问题 gfff文件的具体意义

这个是您示例Arabidopsis_thaliana.TAIR10.41.gff3文件最后的几段文件,但是我下载的物种数据库下面没有这些,我想要补齐,想问问老师,最下面的这些是什么意思。谢谢!

问题 测序文件中提取基因序列

从公共数据库中的下载的二代基因组测序文件(双端测序:.fastq_1,.fastq_2文件),下载后多个样本后,如何从这些测序文件中提取特定某个基因序列信息进行后续分析特异性分析。

问题 特异分泌蛋白的鉴定

各位老师,我想问下我用得到的某一物种的特异蛋白的CDS序列去NCBI-blast,鉴定是否是这个物种的特异蛋白序列。选择reference genomic sequences数据库时为什么出现这种错误,比对时需要设置一些参数吗,谢谢老师

文章 项目管理工具,选择本地部署还是上云?

...,不用安装服务器,可即时开通使用。根据Garther的统计数据,近年来云服务市场一直以两位数增长,越来越多的企业选择“上云”,项目管理领域的云服务工具也得到越来越多企业的青睐。 一、本地安装和云服务 本地安装...

文章 R语言基础入门—运算符!

...简单快速,学习链接:基因家族分析实操课程 2. 转录组数据理解不深入?图表看不懂?点击链接学习深入解读数据结果文件,学习链接:转录组(有参)结果解读;转录组(无参)结果解读 3. 转录组数据深入挖掘技能-WGCNA,...

问题 conet构建网络

请问我的数据是一个实验设计有5个处理,每个处理做了3个重复样测序,想做一下每个处理的单独的otu网络,只有3个重复,800多个otu,在用conet构建网络,在过滤那步跑了几天也没跑完,是不是样品量太少的时候不能用conet啊?

文章 扩增子16S/ITS/18S微生物多样性课程更新-机器学习随机森林分析

...法,应用的也最多。近年来,利用机器学习分析微生物组数据发了不少高分文章,CNS级别文章中频频出现机器学习分析结果的展示,以下为分析原理及文献解读连接:《随机森林在微生物数据应用-文献讲解》、《 肠道微生物可...

问题 BSR-SEQ

您好老师~我在做BSR-seq数据分析的时候,总是出现Insert size out of range。我用的hasit2比对,samtools sort,然后再用java picard 来reoder,sort……。就出现了这个问题

问题 聚类前后,基因总数有较大差异

请问大家,对转录组数据进行聚类分析后,发现聚类后的基因总数比聚类前的基因总数少了大约40%,这是怎么回事呀。

文章 CDS、ORF、cDNA、mRNA、外显子、内含子等区别与联系

...14.日常科研中你我经会常遇到看不懂的图表,不会挖掘的数据,没有思路的文章,沟通不畅的个性化分析,求人不如求己,一切痛点都能解决:1. 单细胞/空间转录组正在大火,高分文章必备,0基础学单细胞/空间转录组分析,做...

问题 结构变异注释结果文件为空

老师,您好,我在进行结构变异分析的注释这一步后,发现输出的文件都是空的,前面的代码跑出来也没有问题,不知道是什么原因造成的。我的VCF文件中只有插入和缺失数据,见下图。

问题 下图的文件是怎么得到的

老师  我想问一下 泛基因家族里面的这个数据是怎么得来的  是在The pan-genome and local adaptation of Arabidopsis thaliana这篇文章中下载的  还是自己做的呀

文章 Nature:2019年度最佳科学图片top10,总有一张震撼到你!

...于烈酒啊! 除了以上11张图片之外,Nature杂志的编辑们还筛选了几张非常特别的照片,一起来看看—— 沉睡的海豹: 蜂蜜猎人:中国南方的傈僳族人冒着生命危险从蜜蜂的蜂箱里采集珍贵的蜂蜜↓ 受伤的猿猴:来自于一...

文章 如何高效的管理技术开发团队

...管理: 活动统计报表,项目报表的导入和导出功能,信息筛选,预警和邮件提示 8. 共享管理:团队新闻,Wiki和论坛等功能   CORNERSTONE项目管理工具,刚好就具备了这些功能!     那么在使用CORNERSTONE项目管理过程中,TA是如...