找到约 15 条结果

问题 老师,我安装好docker desktop,按照视频下载阿里云镜像,但是搜索不到镜像,怎么办

问题 cytohubba筛选hubgene

wgCNA一个模块中找hub基因 我把cytoScapeinput-edges文件输入cytoscape中 用cytohubba计算 但是每次出来的结果都不一样 试了很多遍也不行 求解答 谢谢!

文章 WGCNA剔除异常样本

做WGCNA分析,需要对基因和样本进行一定的筛选。一般来说,会采用如下的筛选方案: 1.  筛选掉基因表达丰低, 在各个样本中变化不大的基因 2. 筛选掉异常的样本 基因的筛选,比较好处理。但是异常样本比较难办,可以参...

问题 老师您好,我在做WGCNA分析时,无法打开'9.Module_membership文件,相关报错截屏和操作文件发布,请问老师,是哪一步出了问题?该如何解决?谢谢老师。

trait.txtlncRNA_expressionMatrix.rar

问题 关于TajimaD的筛选问题

...将同一区间栽培品种的value值除以地方品种的value值后再筛选

问题 二次搜索时提示新建立的domain_new.hmm没有TC阈值

错误提示信息如下: Error: TC bit thresholds unavailable on model domain 可以用e值代替吗

问题 Meme搜索蛋白motif网页结果显示与TB-tools打开.xlm文件的不一致

老师,您好! 我正在学习基因家族分析,用meme搜索蛋白质的motif,-nmotifs设置为10, 但是网页上只显示了5个且motif location里面没有图片显示,而用tb-tools打开.xlm文件里面有10个 请问导致网页与Tb-tools结果不一致的原因是什么呀...

问题 hmmer搜索结构域

hmmer搜索结构域最后一步时遇到一个问题,我经验证过每个基因在CDD数据库中都有WRKY结构域和锌指结构,但是后面做到蛋白质全长多序列比对分析用GeneDoc查看结构域时发现有些基因结构域不全,好多基因都没有锌指结构显示...

问题 转录组测序cleandata的筛选标准是什么?

问题 基因家族分析时搜索到两个没有组装到染色体水平的基因,请问可以删除这两个基因吗

问题 老师你好,我在再次搜索新建物种特异hmm模型时,显示segmentation fault,请问是怎么回事呢

文章 WGCNA、生存分析、ROC共同筛选biomarker

...对过敏性哮喘疾病,利用WGCNA,鉴定关键模块和hub基因,筛选Biomarker的文献(链接),今天将介绍一篇新的文献:针对多形性胶质母细胞瘤,利用WGCNA筛选关键模块中的hub基因,同时结合生存分析、ROC曲线利用其他数据库数据进...

问题 老师,我想问一下,我的E值有好多是0,这怎么筛选啊!

老师,我想问一下,我的E值有好多是0,这怎么筛选啊!

问题 基因家族成员,筛选差异表达基因

老师,您好!一般分析完某个基因家族成员后,对其进行验证,请问公开的转录组测序数据怎么找呢?从转录组数据中怎么找出差异表达基因?

问题 筛选两个结构域

hmmsearch --domtblout WRKY_hmm_out.txt --cut_tc WRKY.hmm Arabidopsis_thaliana.TAIR10.pep.all.fa 这是上课讲的hmm筛选出一个结构域,如果想筛选出两个结构域同时存在的应该怎么写脚本