wgCNA一个模块中找hub基因 我把cytoScapeinput-edges文件输入cytoscape中 用cytohubba计算 但是每次出来的结果都不一样 试了很多遍也不行 求解答 谢谢!
做WGCNA分析,需要对基因和样本进行一定的筛选。一般来说,会采用如下的筛选方案: 1. 筛选掉基因表达丰低, 在各个样本中变化不大的基因 2. 筛选掉异常的样本 基因的筛选,比较好处理。但是异常样本比较难办,可以参...
trait.txtlncRNA_expressionMatrix.rar
...将同一区间栽培品种的value值除以地方品种的value值后再筛选呢
错误提示信息如下: Error: TC bit thresholds unavailable on model domain 可以用e值代替吗
老师,您好! 我正在学习基因家族分析,用meme搜索蛋白质的motif,-nmotifs设置为10, 但是网页上只显示了5个且motif location里面没有图片显示,而用tb-tools打开.xlm文件里面有10个 请问导致网页与Tb-tools结果不一致的原因是什么呀...
hmmer搜索结构域最后一步时遇到一个问题,我已经验证过每个基因在CDD数据库中都有WRKY结构域和锌指结构,但是后面做到蛋白质全长多序列比对分析用GeneDoc查看结构域时发现有些基因结构域不全,好多基因都没有锌指结构显示...
...对过敏性哮喘疾病,利用WGCNA,鉴定关键模块和hub基因,筛选Biomarker的文献(链接),今天将介绍一篇新的文献:针对多形性胶质母细胞瘤,利用WGCNA筛选关键模块中的hub基因,同时结合生存分析、ROC曲线利用其他数据库数据进...
老师,我想问一下,我的E值有好多是0,这怎么筛选啊!
老师,您好!一般分析完某个基因家族成员后,对其进行验证,请问公开的转录组测序数据怎么找呢?从转录组数据中怎么找出差异表达基因?
hmmsearch --domtblout WRKY_hmm_out.txt --cut_tc WRKY.hmm Arabidopsis_thaliana.TAIR10.pep.all.fa 这是上课讲的hmm筛选出一个结构域,如果想筛选出两个结构域同时存在的应该怎么写脚本