基因组构建HISAT index的信息如 将reads 与基因组进行比对map的命令如下 比对结果如下图所示
...93 196418 317811 514229 832040 question:为什么输出的是上面的结果,而不是最后一个值832040?
程序正常运行 这是最后的结果 GFF源文件 请老师指教,谢谢!
...进行选择要查询的内容,查询结构域;超家族等信息查看结果
... of Separator to groups,可将1改为2或3或4,5.......这个是为了显示名称的前几位, 更改名称和线条颜色: 下图一些参数设置,依次是上下图例,参数等,show X、show Y网格线 图片刻度线的最大值,最小值 保存导出图片,导...
...2. 启动docker及下载扩增子镜像: docker search omicsclass #搜索omicsclass提供的docker镜像docker pull omicsclass/ampliseq-q1 #下载扩增子镜像docker images #检查是否下载完成 3. 在D盘下建立FAPROTAX文件夹,把准备好的三个文件放进去。 4...
...出入(起初只是发现蛋白质序列过长,就用基因组ID在NCBI搜索了一下),请问此时应该以哪个数据为主?
... ID文件,可是在使用时出现这个报错。 然后去GFF 文件里搜索 可能是这没gene原因,这个也没什么用,该怎么避免这个报错,或者跳过呢 谢谢老师啦!
...这里便不多介绍了。 下载镜像并运行 安装好Docker后,搜索我们omicsclass提供的docker镜像,其中便有安装好samtools软件的镜像。 $ docker search omicsclassNAME DESCRIPTION ...
...TAO和FN的基因在bed文件里找不到,,但是我在bed文件手动搜索报错的第一对:evm.model.chr0.498 evm.model.chr0.533 ONI03914 ONI03980是可以搜到的,,,请教老师,这个怎么改才能出图啊,以下是我TAO和FN文件的截图:
..._collinearity_within_gene_failies.pl分析连线时,生成的文件里有结果。
ANNOVAR注释结果中各列的表头说明: ID 详解 Chr 染色体 Start 变异位点在染色体上的起始位置 End 变异位点在染色体上的结束位置 Ref 参考基因组碱基型 Alt 变异碱基型 Func.refGene 对变异位点所在的区域进行注释(e...
...细胞的新克隆,肿瘤组织中这些细胞的丰度与较差的预后结果相关。此外,我们证明白斑和肿瘤组织中的成纤维细胞表达 COL1A1,它与 CD44+ 恶性细胞相互作用,促进 HNSCC 进展。 CD4+FOXP3+调节性T细胞在白斑中扩增并在胶原刺激下表...
...点,这样能够减少我们后面修改的次数更容易得到想要的结果,首先确认自己的路径和绘图需要的文件,需要3个文件,做相关分析的同学肯定不陌生分别是 一般做微生物相关分析都需要这三个文件,有的地方分类信息和丰度表会组...
我做转录组测序,结果中有2个基因序列,它们在NR库中得到了相同的注释(gb编码相同),在Swissprot中得到的注释却不同。能解释一下数据库比对的原理吗?为什么会出现这种现象?