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问题 如何将提取domain的脚本修改为提取所有domain？

...本提取的是第一个domain，如要提取其他domain，请修改脚本27行$a[9]==1为第一个，$a[9]==2为第二个，依次类推 请问如果想把脚本（script/domain_xulie.pl ）修改为提取所有domain应该怎么修改呢？

问题 circos作图上染色体颜色的设置

...？而且基因家族成员不在这些大片段复制里。不过它们有2对是串联重复就是了。 我的问题是，我做出来的circos图，第25-33号染色体，颜色都是黑色。这个如何设置呢？颜色一样，这样似乎不太好。我想让这些和其他染色体一样...

文章 linux将一个文件复制到多个文件夹

...烦很多 不过和其他命令搭配也可以实现 echo 路径1 路径2|xargs -n 1 cp -v 需要复制的文件 当然，路径可以一直加，也可以使用特殊符号表示 比如想给~/test/中所有文件夹都加一个~/file.txt的文件 echo ~/test/*/|xargs -n 1 cp -v ~/file.txt ...

问题 重测序var_density.R脚本报错

...F，没有图片。 Error in seq.default(0, chorm.maxlen/bp, round(xticks[2])) :   invalid '(to - from)/by' Calls: CMplot -> DensityPlot -> seq -> seq.default Execution halted

问题 重测序var_density.R脚本报错

...F，没有图片。 Error in seq.default(0, chorm.maxlen/bp, round(xticks[2])) :   invalid '(to - from)/by' Calls: CMplot -> DensityPlot -> seq -> seq.default Execution halted

文章 使用MCscan进行多物种共线性分析与绘图

...显示： 通过以上操作，我们已经完成了全部的绘图准备工作，接下来我们只需要输入指令进行绘图： python3 -m jcvi.graphics.karyotype all.seqids all.layout --format=pdf --figsize=15x10 --shadestyle=curve --chrstyle=roundrect -o all.pdf 这里重点给大家介...

文章 ggplot2分面facet_grid调整坐标

ggplot2分面设置facet_grid实现一页多图 facet_grid(facets, margins = FALSE, scales = "fixed", space = "fixed",  shrink = TRUE, labeller = "label_value", as.table = TRUE,  switch = NULL, drop = TRUE) 设置 含义 facet_grid(. ~ cyl) 按cyl分面,行为1,进...

文章 设置非root用户运行使用docker

...组，如果docker用户组存在可以忽略 sudo groupadd docker 2、把用户添加进docker组中 sudo gpasswd -a omicsclass docker 3、重启docker，用户重新登录系统就可以使用docker了 sudo service docker restart #centos6 systemctl restart docker #centos7 ...

文章 菠萝WRKY基因家族分析

...外还选取了部分最终的菠萝中的WRKY基因做PCR扩增验证。 2、基因家族系统进化树分析 通过对54个WRKY基因的蛋白质序列进行多序列比对，利用MEGA软件，构建系统进化树，同时把拟南芥当中的WRKY基因也加进去一起构建进化树，方...

问题 如何在linux服务器上安装paircoil2

我从paircoil2的网站上下载了paircoil2-linux-amd64.tar.gz安装包，然后上传到服务器上并解压后， 如图所示，怎么安装运行paircoil2？ 我看README中说是如下这样安装 请问这是什么意思，怎么安装呢，怎么放到家目录下之类的？ ...

问题 fastq-dump下载问题？

...忙看一下嘛，failed to open SRA manager是怎么回事？ fastq-dump.2.8.0 err: path not found while searching dynamic library within file system module - failed to open SRA manager ============================================================= An error occurred during processing. A report...

文章 拨乱反正-下载2019年最新中科院期刊分区+影响因子汇总表-生命科学类

最近2019年中科院期刊分区表让几个公众号闹得乌烟瘴气，硬生生将JCR的区分表当做中科院期刊分区表分享出来；一众小号如获至宝地纷纷跟发，估计现在还有很多老师仍蒙在鼓里，赶紧检查下，您是不是也领取了假表！ 拨乱反...

问题 IsoSeq3：三代测序不同长度的library的合并问题

您好。我现在测了三代转录组的三个不同片段文库，分别是1-2kb，2-3kb和3kb以上。如果用IsoSeq3流程进行分析的话，请问这三个文库应该在哪一步合并呢？是在isoseq3 cluster的这一步之前，自己用pbmerge合并么？还是在哪里合并呢？

问题 叶绿体GetOrganelle组装不成环，调整后还是不行

...项），或者不指定-s选项，均不成环：contigs有15段。 2、novoplasty组装：Building Hash Table...Killed！

文章 群体进化和GWAS文章没那么难发！

...文章好发表么？ 在这里，小编就给大家简单的解读一篇2017年5月发表在《Nature Genetics》上的基于全基因组重测序技术的GWAS文章。这篇文章的思路相对简单，也比较标准，不外乎遗传多样性部分+性状关联部分+与前文对应的讨论...