...e.pl提取基因上游1500bp, 出现如下报错,且最终得出结果不全, 得到的结果文件如下,有些有ID但是序列为空,有些(RmPMTID_loc.txt中最后3个)连ID号都没有出现在结果里。 RMU_r2.0_genome.fa为基因组序列 RmPMTID_loc.txt为基因位置...
我查到的关于LD的计算都是在Aa这样的基因型之间的计算方式,但我们平时实验的时候是碱基序列更多一些,针对每个基因位点,应该如何考虑它的LD计算。
有老师在做基因家族分析时,构建进化树时会报错,可能是基因序列差异太大造成的,按说是同一个基因家族的成员,含有相同的蛋白保守结构域不应该出现这种情况。 第一种情况就是序列之间的确差异很多,需要删除比对后...
...、水稻和烟草)的共48个NRAMP 基因家族成员,并通过转录组分析对5种重金属(Pb2+、Cu2+、Cd2+、Zn2+、Ni2+)作用下,马铃薯中NRAMP 基因家族成员的表达模式进行了探究。此外,为了深入研究 NRAMP 家族成员在不同物种之间的同源性,作者...
...连接(http://www.clustal.org/download/current/) 选择自己需要的版本 clustalw-->test.fa-->2-->1-->test.dnd-->test.aln-->X#clustalw调用该函数#test.fa输入比对数据#2选择多序列比对#1进行比对#选择输出文件*.dnd#选择输出文件*.aln#退出X ...