问题 mRNA和gene ID不一致如何进行修改

如何将mRNA的ID和gene ID弄成一样的啊都是gene ID那样的方式，谢谢

问题 不知道为什么，产生不了unmap文件

进行基因预测的时候，发现生成不了unmap文件，然后发现是上一步组装的时候，只用了megahit做单样本组装，后面抽出未组装进行混合组装的那一步没做？是这个原因吗 应该怎么调整代码？

文章 runc 与 containerd.io 冲突安装不上runc

是因为与/etc/yum.repos.d/docker-ce.repo有关，删除这个文件，然后运行yum update -y更新缓存

问题 老师，我在水稻转录因子文库中筛选出来了一些转录因子，我想预测一下它的下游靶基因，并制作一张调控网络图，不知道如何下手，我买了组学大课堂的那个转录组的课程，但是还是不咋懂，希望老师能帮助一下我，谢谢！

问题 请问用相同的文件，只是把名字改了一下，然后docker自动把重复的序列删除后，为什么出来的motif不一样啊，然后我又把名字改成不一样的，让他不能过滤掉重复序列，之后生成的就和之前的一样了，是什么回事

文章 基因组注释流程，PASA mysql 数据库启动 exited

...-21 09:38:40+00:00 [Note] [Entrypoint]: Entrypoint script for MySQL Server 5.7.41-1.el7 started.2023-03-21 09:38:40+00:00 [ERROR] [Entrypoint]: mysqld failed while attempting to check configcommand was: mysqld --verbose --help --log-bin-index=/tmp/tmp.ogWM7TzzGmmysqld: Can't read dir of '/etc/mysql/...

问题 做BSA混池定位时，亲本不纯，还有分离，可以做么？

问题 gff文件的ID和蛋白质，cds文件不一致

问题 在TCGA构建ceRNA网络，数据用代码下载不完全啊

问题 老师如果有服务器的话，是不可以不用下载docker

问题 老师，这个done之后不动了，开始运行了吗？如何判断呢？

文章 GFF文件格式不标准，第三列只有GENE处理方法

先把gene 搜索替换成mRNA，再参考这里修改一下： 可以参考这里：https://www.omicsclass.com/article/816

问题 老师们好，这是我的基因定位在染色体上的位置，总共的scaffold数有3864个，但是七鳃鳗里面染色体有72条，所以这里怎么转换我不明白，我这个里面它好像默认了scaffold就是染色体一样，我不知道怎么去转换

问题 mapman注册账号下载mapping文件，验证码图片加载不出来

且打开软件下载mapping文件，左下角一直显示进度条，从不到100%

问题 在计算Kaks时输出的phy文件基因号不完整，但是aln文件完整。怎么解决

phy文件基因号不完整，但是aln基因文件完整，使用aln转化后计算出现not equal,怎么得到完整的基因号phy文件？