问题 泛基因家族转录表达

老师你好。我正在准备以下三个表 请问： 1. gene_Function.annotation.xls的格式必须和示例文件一致吗？有的数据库我没有注释结果。 2.all_gene_fpkm_for_deg.xls  这个文件是指所有的基因表达量吧。那All.DEG_final.xls文件是啥内容？

问题 老师您好，跟着讲解计算转录组power时，提示文件太大，怎么办

有154111个基因

文章 pheatmap绘制聚类热图

...因表达数据热图，需要一个基因表达数值矩阵文件，数据格式往往是行为基因表达数据、列为样本信息（如下图20*6）： 确保安装和加载包之后，正确读取文件，获取数值矩阵即可进行绘图： library(pheatmap)mat=read.table("F:/mat.txt"...

问题 老师您好，我在用CoNet插件做网络分析时Permutaion不出网络，所有的值都为0，怎么办

老师您好，我在用CoNet插件做网络分析时Permutaion不出网络，所有的值都为0，怎么办？

问题 做基因家族分析中的染色体定位图，发现有基因定位在contig上，怎么办？

做基因家族分析中的染色体定位图，发现有一个基因定位在contig上，这种情况下怎么做mapchart前准备文件？直接不做这个基因的染色体定位图可以吗？

问题 plink怎么设置样本的PPID，MID，Sex信息？

我的家系信息和性别信息在.ped文件中都是缺省值，但我实际的数据是有家系和性别的，保存在一个txt中，可以把他放到.ped文件中吗？

问题 在分析基因上游顺势元件时出现这个报错信息时，怎么办

输入文件为以下两个文件 脚本为

问题 在计算Kaks时，想提取多对基因的序列，怎么批量提取？

学习的方法只能一对一对的提取，有什么批量提取基因对序列的方式吗？

问题 内含子个数和外显子个数怎么通过out文件看出来啊

bZIP_gtf.txt

问题 SeparateChromosomes2划分连锁群不合理怎么解决

...一条染色体上的bin划分在各种不同的连锁群。这个问题该怎么解决呢。

问题 老师，从原版上或者你的改进版上下载或者安装qtlseq的时候，用conda创建环境安装的时候，怎么分别安装到两个人的版本？

如果我利用下面的安装，我安装的是黄老师的，还是原来的那个人的？怎么分别？或者怎么安装到两个版本

问题 McscanX做圈图时有缺口，怎么让它变成一个完整的圆？

在作图得到圈图的时候我们的图出现了很大的缺口！help！

问题 老师好！我在运用课程代码进行Treemix分析后，会生成：cov.gz,modelcov.gz,treeout.gz等相关文件，现在我想知道：在混合事件的情况下，覆盖方差的比例和估计的混合比例，这个应该怎么进行计算统计呀？我不清楚这个解释比例是怎么计算的？谢谢老师！

文章 TCGA中样品取样组织类型编号对照包 sample type

...库联合挖掘胰腺导管腺癌预后关键基因TCGA数据库挖掘-肾细胞癌相关biomiarker筛选案例解析文献精读-TCGA数据挖掘生物信息文章（肺鳞癌）文献精读-GEO数据挖掘生物信息文章（宫颈癌）GEO数据挖掘直肠KM-plotter在线做生存分析GEO数...

问题 老师，您好！请问你一下 怎么把多个物种MCScanX的结果整理出下图的形式？