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问题 如何对筛选的区域进行注释呢?

使用bedtools根据ROD对样本进行了筛选区域的基因提取,获得了top5的基因txt文件,文件里大概只有基因的loc号码和位置等信息,并没有注释信息,应该怎么做呢?

问题 用bHLH的第一个pfam号hmmer搜索不出来,是哪里出问题了?

文章 一键显示影响因子与分区

大家在搜索查看英文文献的时候,如果想知道期刊的影响因子和分区,那么就需要二次搜索。多了一步搜索,就稍显繁琐。今天小编给大家介绍一款可以自动加载期刊影响因子和分区的插件(Scholarscope),该插件还具有文献管理...

问题 筛选不到串联重复基因

...! 我在做WRKY基因家族分析时,使用perl脚本KAKS_SHAIXUAN.pl筛选串联重复基因,找不到有序列符合教程中说的序列相似度75%以上,且比对到的长度大于长序列的75%长度,请问这合理吗?主要是第二个标准达不到要求,请问能否将第...

问题 关于WGCNA模块hub基因筛选的问题

网站提供了通过KME值来筛选hub基因的方法如下:datKME=signedKME(datExpr, MEs, outputColumnName="kME_MM.") 能提供通过MM和GS方法分析hub基因的代码和分析吗?

问题 WGCNA分析基因筛选

    大家好,做WGCNA分析,是只选择表达差异基因来做吗?不同处理的差异基因取并集?

问题 对于没有Pfam号的,Blast搜索之后应该怎么做呀,看完视频还是蒙蒙的

视频最后说的接hmmer的地方是这里吗

问题 安装了最新版本的eclipse之后,Eclipse Marketplace搜索不到perl插件

老师您好,下载了最新版的Eclipse IDE for Eclipse Committers包之后,Perl插件与它不兼容,请问这个应该怎么解决呢?

问题 Meme搜索蛋白motif网页结果显示与TB-tools打开.xlm文件的不一致

老师,您好! 我正在用meme搜索蛋白质的motif,发现motif网页结果显示与TB-tools打开.xlm文件的不一致 以下为网页结果:看下面红色方框里面的3个 以下为tb-tools结果:看下面红色方框里面的3个 还望老师赐教,谢谢!

问题 WGCNA 表达量低的基因筛选

老师:       您好!我先筛选fpkm小于0.5的基因(共53614,筛选后31361个基因),去做共表达网络,得到两个相关性较高的模块,模块1(基因数量20932   相关系数0.91,p值0.002),模块2(基因数量539   相关系数-0.89,p值0.003)....

问题 motif筛选的条件

你好老师,我想问一下motif的长度最短应该根据什么来定,最长是否需要比pfam数据库中观测到的长度要长

问题 附图,,,,请问阈值太大了怎么筛选

问题 hmm搜索到的基因特别多怎么办?E值选择有什么样的要求

问题 老师,如果用CDD(Batch CD-Search)搜索鉴定,出现这种情况,通常是什么原因?

问题 老师,如果用CDD(Batch CD-Search)搜索鉴定,出现这种情况,通常是什么原因?