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文章 iTOL对进化树添加外部标签

...之后几列分别是颜色、字体、大小以及方向设置。准备好数据后就可以加到进化树中了。 此外,我们在网易云课堂上有各种教学视频,有兴趣可以了解一下: 1. 文章越来越难发?是你没发现新思路,基因家族分析发2-4分文章...

文章 2020年1-4月100+篇基因家族分析文献信息免费领取

...件分析; 6. 家族内基因表达模式分析(结合转录组或QPCR数据); 近日小编搜索了下2020年1-4月期间在线发表的基因家族分析类文献,才发现原来短短3个多月就已经发表了上百篇该类文章了,小编整理了其中100+篇成EXCEL,供大...

文章 maftools 癌症组织突变频谱展示工具

...种癌症类型的样本量超过200种。由体细胞变体组成的结果数据以MAF格式形式存储。 只要数据采用MAF格式,该软件包就会尝试从TCGA源或任何内部研究中有效地汇总,分析,注释和可视化MAF文件. 使用说明: https://www.bioconductor.org/...

文章 HTML 转 PDF

...简单快速,学习链接:基因家族分析实操课程 2. 转录组数据理解不深入?图表看不懂?点击链接学习深入解读数据结果文件,学习链接:转录组(有参)结果解读;转录组(无参)结果解读 3. 转录组数据深入挖掘技能-WGCNA,...

问题 两个群体的snp-index怎么算?

老师您好,我的snp数据有两个性状差异比较大的群体,每个群体有30个个体,现在我想算snp-index,问题是测序的时候是单个测序的,也就是说一共测了60个个体的重测序,我想使用BSA类似的方法可是BSA都是要求混池测序,请问怎...

问题 问一个玉米基因芯片ID转换的问题

老师: 您好! 我最近在做玉米基因芯片的数据分析工作。但是我发现芯片文件(GPL.soft)中这些ID都很生僻(如图),不知如何转换成传统ID? 貌似那个TIGR ID已经绝版了?我在TIGR ID的对应网站无法下载到对应的转换文件(http:/...

文章 已测基因组植物统计(增补完善版),建议收藏!

... 日常科研中你我经会常遇到看不懂的图表,不会挖掘的数据,没有思路的文章,沟通不畅的个性化分析,求人不如求己,一切痛点都能解决: 1. 单细胞/空间转录组正在大火,高分文章必备,0基础学单细胞/空间转录组分析,...

文章 堂堂院士也抄袭?《Science》发文:学术抄袭哪国强?

...记者怎么能知道这些事情?! Excuse me? 李院士,别人数据凿凿,有理有据,知网上一查,是个普通人就知道了,怎么就扯到“科研评估机构”上? 难道你忘了,不知知网的翟博士,就是被某看直播的小伙伴给揪出来了? 《Sci...

问题 (WGCNA) 已有基因模块分析结果,如何将其继续转换成可以用于cytoscape作图的文件?

...个样本中归一化的数值)。 其实就是WGCNA课程里将分析数据转换成cytoscape绘图文件之前的分析结果都以excel展示了,如何把这些excel结果继续转换成用于cytoscape绘图的文件? 先谢过各位老师! 我这些文件里没有基因-基因的对...

文章 详细介绍如何利用iTOL在进化树中用颜色体现样品分组信息

...简单快速,学习链接:基因家族分析实操课程 2. 转录组数据理解不深入?图表看不懂?点击链接学习深入解读数据结果文件,学习链接:转录组(有参)结果解读;转录组(无参)结果解读 3. 转录组数据深入挖掘技能-WGCNA,...

文章 按物种拆分blast本地库

...本上所有现有已知物种的序列信息,在进行blast时,由于数据库较大,搜索时间会比较长,同时可能会有其他物种信息干扰。因此我们可以根据NCBI提供的物种分类号对其进行拆分,下面以nr库进行举例说明。 一、准备 1.1、数据...

问题 想问一下泛基因组分析时,基因家族的鉴定中选择a个物种;SV分析是文章中构建的b个物种中的;转录组分析是c个物种中的;请问a受b,c的影响吗?a:能不能我找到13个基因组就在13个基因组里面分析呢?而b和c是文章中找到的,利用人家的数据分析自己的基因,这样的理解对吗?

文章 R语言基础入门—矩阵介绍

...布局布置的R对象, 它们包含相同原子类型的元素。这种数据结构很类似于其它语言中的二维数组,但 R 提供了语言级的矩阵运算支持。 矩阵里的元素可以是数字、符号或数学式。 一个 M x N 的矩阵是一个由 M(row) 行 和 N ...

文章 电脑双显示器如何配置?

这年头搞生物的不学点生信还真不行,没学生信之前,数据不会分析,更不会深入挖掘;自从掌握了生信技能,办公效率高了,文章产出多了,科研也不再那么枯燥乏味了!爱生信,拥抱向上的生活! 子曰“工欲善其事,必先...

文章 Perl数组排序--sort()函数

...简单快速,学习链接:基因家族分析实操课程 2. 转录组数据理解不深入?图表看不懂?点击链接学习深入解读数据结果文件,学习链接:转录组(有参)结果解读;转录组(无参)结果解读 3. 转录组数据深入挖掘技能-WGCNA,...